[发明专利]一种与水稻小种专化性抗稻瘟病基因紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明属于作物分子遗传育种学领域，公开了一种与水稻小种专化性抗稻瘟病基因紧密连锁的分子标记及其应用，包括如下步骤：(1)取水稻样品，提取水稻样品基因组DNA；(2)利用RM24019和RM24048中的任意一对分子标记的引物，对水稻样品基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增产物进行电泳检测，如果扩增出对应大小的分子标记DNA片段，标志着Pi‑hk2(t)基因的存在。通过本发明提供的水稻小种专化性抗稻瘟病基因Pi‑hk2的分子标记可以检测水稻黑壳子粳及其杂交、回交和复交后代是否含有该基因，可预测其对稻瘟病的抗性水平，大大提高水稻抗稻瘟病材料的选择效率，加快抗病育种进程。

技术领域

本发明属于农作物分子遗传育种学领域，涉及一种与水稻小种专化性抗稻瘟病基因紧密连锁的分子标记及其应用。

背景技术

水稻是我国最重要的粮食作物之一，对保障我国粮食安全和国民经济增长具有重要意义。稻瘟病是我国水稻生产上最严重的病害，具有传播快、发生广、危害重等特点(凌忠专等，1989，我国北方稻区稻瘟病菌生理小种研究.中国农业科学，22(3):7-13)。进一步发掘和利用我国抗稻瘟病基因资源，培育和种植抗病品种是控制稻瘟病发生和减少水稻产量损失最经济有效的途径。

迄今，各国科学家从水稻中鉴定了100多个抗稻瘟病基因，其中有24个抗病基因被成功克隆。这些抗病基因可以引入或聚合到现代品种，选育出高抗、广谱的品种。但传统育种方法费时、费力、表型鉴定困难、育种效率低，由于抗病基因多为显性、基因间往往存在上位性互作，抗病基因聚合更为困难。通过分子标记辅助育种可以有效解决这一问题。

我国太湖流域稻作历史悠久，被认为是粳稻起源地之一，蕴藏有丰富的稻种资源，李培富等(1999，两个太湖流域粳稻地方品种抗稻瘟病的遗传研究.中国水稻科学，13(1):11-14)报道我国太湖流域粳稻地方品种黑壳子粳对稻瘟病菌的抗性表现广谱和高抗的特点。从我国特有的种质资源中鉴定和克隆抗稻瘟病基因，可以获得具有自主知识产权的基因，对提高我国水稻抗稻瘟病育种水平，尤其是粳稻的抗稻瘟病育种有重大意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种一种用于检测与水稻小种专化性抗稻瘟病基因紧密连锁的分子标记的引物对或引物对组及其应用。

本发明的另一目的在于提供一种用于检测或辅助检测水稻小种专化性抗稻瘟病基因的试剂盒及其应用。

本发明的又一目的在于提供一种检测水稻小种专化性抗稻瘟病基因或选择水稻抗稻瘟病品种的分子标记方法及其应用。

本发明主要提供水稻品种黑壳子粳小种专化性抗稻瘟病基因Pi-hk2的分子标记方法。通过检测与抗病基因Pi-hk2紧密连锁的分子标记，可以确定有无抗病基因Pi-hk2，并预测水稻植株的稻瘟病抗性，加快抗稻瘟病水稻新品种的选育进度。

本发明的目的可通过如下技术方案实现：

一种用于检测与水稻小种专化性抗稻瘟病基因紧密连锁的分子标记的引物对或引物对组，所述的引物对为引物对A或引物对B；所述的引物对组由引物对A和引物对B组成；所述引物对A为由如SEQ ID NO.1所示的核苷酸片段和如SEQ ID NO.2所示的核苷酸片段组成的引物对；所述引物对B为由如SEQ ID NO.3所示的核苷酸片段和如SEQ ID NO.4所示的核苷酸片段组成的引物对。

表1为引物对及其所对应的分子标记

上述的引物对或引物对组在制备用于检测或辅助检测水稻小种专化性抗稻瘟病基因的试剂盒中的应用。

一种用于检测或辅助检测水稻小种专化性抗稻瘟病基因的试剂盒，该试剂盒包含有上述的引物对或引物对组。

上述的用于检测或辅助检测水稻小种专化性抗稻瘟病基因的试剂盒还包含有PCR技术常用的试剂。