[发明专利]一种微生物识别方法及系统

权利要求书

1.一种微生物识别方法，其特征在于，包括以下步骤：

步骤一，输入待检测微生物的全基因组序列；

步骤二，计算上述全基因序列的特征向量，将上述特征向量与数据库中预存的特征向量进行距离计算和排序定位，搜索并收敛至记录数少于等于预设数量为止；

步骤三，对搜索得到的一组同输入序列距离最近的记录，进行平均核酸匹配度指标ANI/isDDH和序列比对长度比例的计算，用于判断该待测微生物的属种或亚种。

2.如权利要求1所述的一种微生物识别方法，其特征在于，所述步骤二中的序列特征为基因组DNA的k-mer频数。

3.如权利要求2所述的一种微生物识别方法，其特征在于，所述步骤二中的距离为空间距离。

4.如权利要求3所述的一种微生物识别方法，其特征在于，所述步骤二还包括以下步骤：

根据输入特征向量同预存特征向量计算距离迭代缩小搜索，收敛至距离最小的若干记录；

搜索过程中使用不同的k值同预存或实时计算的向量进行距离计算；k-mer频数根据需要进行均一化处理。

5.一种微生物识别系统，其特征在于，包括输入装置、计算装置、比较装置、输出装置和数据库，所述输入装置用于录入数据，所述计算装置用于计算数值、搜索和排序定位，所述比较装置用于比较计算值与预设值之间的大小关系，所述输出装置用于输出结果，所述数据库用于存储数据。

6.如权利要求5所述的一种微生物识别系统，其特征在于，所述数据库设有基因组序列子数据库。

7.如权利要求5所述的一种微生物识别系统，其特征在于，所述数据库设有基因组序列衍生结构注释和功能注释信息子数据库。

8.如权利要求5所述的一种微生物识别系统，其特征在于，所述数据库设有基因组元信息子数据库。

9.如权利要求5所述的一种微生物识别系统，其特征在于，所述数据库设有基因组序列衍生特征子数据库。

10.如权利要求6所述的一种微生物识别系统，其特征在于，所述基因组序列子数据库用于保存单个微生物分离株的全基因组序列拼装。