[发明专利]一种与猪肉质性状和胴体性状关联的遗传标记

说明书

本发明属于猪的遗传标记制备技术领域，具体涉及一种与猪肉质和胴体性状关联的遗传标记，该标记从猪BMP‑3b基因中筛选得到，其序列如SEQ ID NO：1和图4所示，在该序列425位碱基处发生一个A/G碱基突变，导致AlwNⅠ‑RFLP多态性。筛选方法为：从猪血液中提取基因组DNA，设计引物，PCR扩增，PCR产物克隆、测序，序列比较分析，SNP检测，标记与肉质性状间相关性分析。公开了猪BMP‑3b基因CDS区的SNP分型检测技术，发现该A/G突变位点与大理石花纹、色值、肌内脂肪含量等肉质性状显著相关；与平均背膘厚、眼肌高以及板油等胴体性状显著相关。本发明为猪标记辅助选择提供了新的标记资源。

技术领域

本发明属于猪的分子标记辅助选择技术领域，具体涉及一种与猪肉质和胴体性状关联的遗传标记。所述的遗传标记分离自BMP-3b基因的CDS区片段，本发明还包括所述的遗传标记在猪辅助选择关联分析中的应用。

背景技术

传统的育种主要依赖于表现型选择，而环境条件、基因间互作以及基因型与环境互作等多种因素会影响表型选择效率，使得传统的育种的效率不高，育种工作进展缓慢。育种家在长期的育种实践中不断探索运用遗传标记来提高育种的选择效率与育种预见性。遗传标记是指能够用以区别生物个体或群体及其特定基因型、并能稳定遗传的物质标志，包括形态学标记、细胞学标记、生化标记与分子标记。目前以DNA多态性为基础的分子标记在分子标记辅助选择(molecular marker-assisted selection，MAS)育种中受到人们的普遍重视。分子标记辅助选择是随着现代分子生物学技术的迅速发展而产生的新技术，它可以通过分子标记对基因型做直接选择，从而进行分子育种。分子标记辅助选择具有高准确性，可用于早期选种，缩短世代间隔，与常规育种相结合，可大大加快育种进程。

随着分子生物学的发展，相继建立了RFLP、RAPD、AFLP、SNP等多种分子遗传标记技术。限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析是最早应用于动植物遗传学研究的分子标记技术。将PCR技术用于RFLP分析，即PCR-RFLP。该技术可以用有限的DNA为模板，利用引物特异性扩增基因组的某一区域，然后用限制性内切酶消化PCR产物，电泳检测多态性。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指同一物种不同个体基因组DNA上的某个位点存在单个碱基的变化，包括碱基转换、颠换、单碱基插入或缺失等现象。SNP是基因组中最普遍、频率最高的遗传标记，某些位于基因表达序列内的SNP有可能直接影响蛋白质结构或表达水平，对于复杂表型性状与基因变异之间的关联分析具有重要意义。SNP易于实现自动化分析，被认为是继RFLP、微卫星标记之后的第三代分子标记，在遗传育种学研究中的应用前景十分广阔。

Bone morphogenetic protein-3b(BMP-3b)也称GDF10，属于TGFβ超家族成员，最早由大鼠股骨中分离克隆得到，主要表达于各种骨组织、软骨组织、骨组织、气管、肺、脑等部位(1996)。BMP-3b基因主要与软骨或骨的生成发育以及胚胎发育相关(1999,2003,2005)。Adoligbe C等发现牛的BMP-3b基因外显子存在三个SNP位点，形成了同义或错义突变，分析发现这些SNP位点与牛的体尺测量性状之间显著相关(2011)。另外还有研究表明BMP-3b基因在脂肪组织中也有较高的表达水平，并且该基因以非共价复合物形式在脂肪细胞中分泌(1995,2011)，在前体脂肪细胞中的表达水平高于成熟的脂肪细胞，能够抑制脂肪细胞分化(2011)。这些研究结果说明BMP-3b基因在脂肪分化发育中起到一定的作用，并且也势必会影响机体脂肪组织的发育进而影响肉质性状和胴体性状。我们克隆了大白猪和梅山猪BMP-3b基因CDS序列，发现该基因在两个猪种之间存在一个SNP位点。大白猪和梅山猪是典型的国外猪种和典型的中国地方猪种，这两个猪种在肌内脂肪含量和大理石花纹等具体肉质性状和背膘厚等胴体性状上差别很大，推测BMP-3b的SNP位点有可能与这两个猪种之间的肉质性状和胴体性状差异相关。

发明内容