[发明专利]一种检测人H3F3A基因突变的探针法及检测试剂盒在审

专利信息
申请号: 201610178701.3 申请日: 2016-03-25
公开(公告)号: CN105734137A 公开(公告)日: 2016-07-06
发明(设计)人: 阎海;焦宇辰;王晓月;王思振 申请(专利权)人: 上海今创医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京中誉威圣知识产权代理有限公司 11279 代理人: 田昕;俞佳
地址: 200439 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 h3f3a 基因突变 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种检测人类H3F3A基因突变的试剂盒,其特征在于,包括H3F3AK27MPCR反应混合液,其中所述H3F3AK27MPCR反应混合液中包括溶解在PCR预混液中的以下组分:具有如序列表中SEQIDNo.1所示序列的H3F3AK27M上游引物、具有如序列表中SEQIDNo.2所示序列的H3F3AK27M下游引物、具有如序列表中SEQIDNo.3所示序列的H3F3AK27M探针、具有如序列表中SEQIDNo.4所示序列的内参上游引物、具有如序列表中SEQIDNo.5所示序列的内参下游引物和具有如序列表中SEQIDNo.6所示序列的内参探针。

2.根据权利要求1所述的检测人类H3F3A基因突变的试剂盒,其特征在于,所述H3F3AK27MPCR反应混合液中各组分在PCR预混液中的浓度为:所述H3F3AK27M上游引物的浓度为2-4μM,优选3μM;所述H3F3AK27M下游引物的浓度为2-4μM,优选3μM;所述H3F3AK27M探针的浓度为2-4μM,优选3μM;所述内参上游引物的浓度为1-3μM,优选2μM;所述内参下游引物的浓度为1-3μM,优选2μM;所述内参探针的浓度为1-3μM,优选2μM。

3.根据权利要求1或2所述的检测人类H3F3A基因突变的试剂盒,其特征在于,所述H3F3AK27MPCR反应混合液的PCR预混液中还溶解有dUTP和尿嘧啶DNA糖基化酶;所述dUTP在PCR预混液中的浓度为0.05-0.8μM,优选0.2μM,所述尿嘧啶DNA糖基化酶在PCR预混液中的浓度为0.005-0.02U/μl,优选0.01U/μl。

4.根据权利要求1-3之一所述的检测人类H3F3A基因突变的试剂盒,其特征在于,还包括弱阳性对照液和/或空白对照液。

5.根据权利要求4所述的检测人类H3F3A基因突变的试剂盒,其特征在于,所述弱阳性对照液为H3F3AK27M突变率为10%的人类基因组DNA,或者是按照如下方法制备的弱阳性对照液:含有H3F3AK27M突变的阳性质粒溶解在没有H3F3AK27M突变的人类基因组DNA水溶液中,使得阳性质粒与没有H3F3AK27M突变的人类基因组DNA的拷贝数为1:9,所述阳性质粒与没有H3F3AK27M突变的人类基因组DNA在弱阳性对照液中的核酸总浓度为2-10ng/μl,优选为10ng/μl;所述空白对照液是TE缓冲液。

6.一种检测人类H3F3A基因突变的实时荧光定量PCRTaqman探针法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)在H3F3AK27MPCR反应混合液中加入从样品中提取的、作为模板的人类基因组DNA,形成H3F3AK27M反应体系并进行荧光定量PCR扩增,其中:

所述H3F3AK27MPCR反应混合液中包括溶解在PCR预混液中的以下组分:具有如序列表中SEQIDNo.1所示序列的H3F3AK27M上游引物、具有如序列表中SEQIDNo.2所示序列的H3F3AK27M下游引物、具有如序列表中SEQIDNo.3所示序列的H3F3AK27M探针、具有如序列表中SEQIDNo.4所示序列的内参上游引物、具有如序列表中SEQIDNo.5所示序列的内参下游引物和具有如序列表中SEQIDNo.6所示序列的内参探针;

(2)结果判断:根据人类基因组DNA在K27M反应体系进行荧光定量PCR扩增时的突变Ct值进行分析。

7.根据权利要求6所述的检测人类H3F3A基因突变的实时荧光定量PCRTaqman探针法,其特征在于,所述H3F3AK27M反应体系为:在16-20μlH3F3AK27MPCR反应混合液中加入1-4μl、浓度为2-10ng/μl的人类基因组DNA,优选在18μlH3F3AK27MPCR反应混合液中加入2μl、浓度为10ng/μl的人类基因组DNA;所述H3F3AK27MPCR反应混合液中各组分在PCR预混液中的浓度为:所述H3F3AK27M上游引物的浓度为2-4μM,优选3μM;所述H3F3AK27M下游引物的浓度为2-4μM,优选3μM;所述H3F3AK27M探针的浓度为2-4μM,优选3μM;所述内参上游引物的浓度为1-3μM,优选2μM;所述内参下游引物的浓度为1-3μM,优选2μM;所述内参探针的浓度为1-3μM,优选2μM。

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