[发明专利]鉴定鲁棉研34号品种纯度的SSR分子标记引物组及其应用在审
申请号: | 201610152563.1 | 申请日: | 2016-03-17 |
公开(公告)号: | CN105695587A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
发明(设计)人: | 刘国栋;王芙蓉;张军;张传云;张景霞;陈煜;周娟 | 申请(专利权)人: | 山东棉花研究中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 朱家富 |
地址: | 250100 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 鲁棉研 34 品种 纯度 ssr 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种鉴定鲁棉研34号品种纯度的SSR分子标记引物组,该引物组由5对引物组成, 分别为:
分子标记NAU3995的引物,上游引物核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,下游引物核苷 酸序列如SEQIDNO.2所示;
分子标记MUCS101的引物,上游引物核苷酸序列如SEQIDNO.3所示,下游引物核苷 酸序列如SEQIDNO.4所示;
分子标记DPL0917的引物,上游引物核苷酸序列如SEQIDNO.5所示,下游引物核苷 酸序列如SEQIDNO.6所示;
分子标记DPL0528的引物,上游引物核苷酸序列如SEQIDNO.7所示,下游引物核苷 酸序列如SEQIDNO.8所示;
分子标记NAU4926的引物,上游引物核苷酸序列如SEQIDNO.9所示,下游引物核苷 酸序列如SEQIDNO.10所示。
2.权利要求1所述SSR分子标记引物组在鉴定鲁棉研34号品种纯度中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,步骤如下:
(1)将待检测棉花干种子室温条件下浸泡后,去除种皮,浸入裂解缓冲液中,破碎后, 在60~70℃水浴15~25min,离心,取上清,然后加入预冷的异丙醇,离心,取沉淀,经洗 涤、晾干,加双蒸水溶解后,离心,取上清,制得DNA提取样品;
(2)以步骤(1)制得的DNA提取样品为模板,分别以SSR分子标记引物组中的5对 引物进行PCR扩增,制得PCR扩增产物;
(3)分别对步骤(2)制得的PCR扩增产物进行电泳检测,经染色后,将染色结果的带 型与鲁棉研34号父、母本的染色结果的带型进行对比,同时具有父母双亲本特异条带的种 子或单株鉴定为真正的杂交种,缺少其中的任意一个条带均被视为假杂种,种子纯度按如下 方法计算:
种子纯度=检测到的与鲁棉研34号纯品的带型相同的个数/检测总数×100%。
根据本发明优选的,所述步骤(1)中的浸泡时间为18~24小时;离心条件为:4℃、 12000r/min离心8min;所述洗涤为采用体积百分比为70%的乙醇溶液洗涤;所述预冷的异 丙醇加入量为0.7倍体积。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述步骤(1)中的裂解缓冲液中含有如下 成分:
2wt%十六烷基三甲基溴化铵,0.02mol/L四乙酸二氨基乙烷,1.4mol/LNaCl,0.1 mol/LTris-HCl,2wt%聚乙烯吡咯烷酮,1wt%β-巯基乙醇。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述步骤(2)中,PCR反应体系如下,总 体系体积10μL:
10×PCRBuffer1μL,10mMdNTPMix0.2μL,10μmol/L的正向引物0.6μL、10μmol/L 的反向引物0.6μL,5UTaqDNA聚合酶0.1μL,20~200ng/μL的待测样品DNA2μL, ddH2O5.5μL。
6.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述步骤(2)中,PCR反应程序如下:
94℃预变性5min;94℃变性40s,55℃退火45s,72℃延伸50s,循环32次;72℃延 伸5min。
7.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述步骤(3)中,所述电泳为采用8wt% 非变性聚丙烯酰胺电泳。
8.如权利要求4所述的应用,其特征在于,所述步骤(3)中,染色步骤如下:
用0.1wt%的AgNO3溶液染色10min,再用含2wt%NaOH和0.4wt%甲醛的水溶液显影 至带型清晰。
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