[发明专利]一种与梨果皮颜色性状连锁的分子标记位点及其应用

说明书

一种与梨果皮颜色性状连锁的分子标记位点及其应用，所述的InDel位点位于砀山酥梨基因组组装Scaffold NW_008988130.1的920222bp处，序列为TATTA或T，编码方向为5'—3'方向。根据该InDel位点开发的SCAR分子标记In2130‑16标记与供试满天红×红香酥群体红皮/绿皮性状位点的遗传距离为4.3cM，能够对供试群体中的所有红梨单株进行选择，选择效率达到100％，可作为梨红皮性状的标记进行育种选择应用，大幅提高红皮梨育种选择的效率，具有很好的应用前景。

技术领域

本发明属于梨遗传育种与分子生物学领域，涉及一种与梨果皮颜色性状连锁的分子标记位点及其应用。

背景技术

梨是国际性的大宗水果，也是我国的主要水果之一，其果实营养丰富，味美多汁，香甜可口，深受人们喜爱。我国是东方梨种的主要起源地，种类和品种资源十分丰富。果皮颜色是最能吸引人们注意的果实性状，是果实品质和商品性的重要组成部分。近年来，健康消费的观念日益深入人心，红色梨被认为具有更高的健康价值而受到市场青睐，红色梨品种的选育也日益受到各国梨育种研究机构的重视。

目前，育种家在梨育种工作中主要采用的是传统的杂交育种手段，杂交种子培育成苗度过数年的童龄期并结果后，再对所有杂种单株生长结果性状进行后期评价，根据评价结果选择留下和淘汰杂种单株。该方法育种周期长，占地面积大，耗时耗力，育种效率低。分子生物学迅速发展并与作物遗传育种学科相结合，产生了分子标记辅助选择育种技术，使得对传统杂交育种获得的杂种单株进行提早选择、高效选择成为可能。

东方梨的红皮/绿皮性状是受主效基因控制和微效多基因调控的数量性状，表现为红皮和绿皮分离规律类似质量性状，但红皮性状着色程度变异范围相对较广。开发东方梨红皮/绿皮性状分子标记并用于分子标记辅助选择育种，可以大大提高红皮梨育种选择效率，节约杂交单株种植养护和调查考种的成本，促进我国梨育种从常规育种向分子育种手段转变。

发明内容

解决的技术问题：为了解决梨遗传育种中存在的周期长、效率低的问题，本发明提供了一种与梨果皮颜色性状连锁的位点及分子标记和应用。

技术方案：一种与梨果皮颜色性状连锁的位点，所述位点位于基因组组装Scaffold NW_008988130.1的920222bp处，序列为TATTA或T，编码方向为5'—3'方向。

一种基于所述位点开发的SCAR分子标记，记为In2130-16，所述位点位于SCAR分子标记扩增产物的内部。

所述SCAR分子标记在梨红皮/绿皮性状辅助选择育种中的应用。

基于所述分子标记选育红皮梨的引物对，

上游引物序列为：5'-AATAGAAATTTAACACCTACGC-3'；

下游引物序列为：5'-ACATATAGCACCCTTAGGAAA-3'。

上述引物对在梨红皮/绿皮性状育种中的应用。

红皮梨辅助选育试剂盒，含有上述的引物对。

有益结果：‘满天红’和‘红香酥’是中国农业科学院郑州果树研究所选育的2个著名的红皮梨品种，在我国推广应用面积较大。这两个品种常被育种单位用作红梨育种的亲本，表现出良好的亲本遗传特点。本发明对‘满天红’ב红香酥’杂交组合群体用In2130-16分子标记进行分析，该SCAR标记能够对供试群体中的所有红梨单株进行选择，选择效率达到100％，能够作为梨红皮性状的标记进行育种选择应用，可以大幅提高红皮梨育种选择的效率，具有很好的应用前景。

附图说明

图1 SCAR标记In2130-16在红皮梨和绿皮梨中的带型图；