[发明专利]一种基于SMAD7基因的猪活体背膘厚标记辅助选择方法

说明书

本发明公开了一种基于SMAD7基因的猪活体背膘厚标记辅助选择方法。本发明的方法为如下：检测猪个体的SMAD7基因第四内含子的第244位脱氧核糖核苷酸是C还是T还是C和T。通过试验证明：本发明用SMAD7基因第四内含子的第244位单核苷酸多态性来鉴定猪活体背膘厚的方法与猪活体背膘厚实际测定结果一致，对选择优良猪种有重要意义。

技术领域

本发明涉及一种基于SMAD7基因的猪活体背膘厚标记辅助选择方法，属于生物技术领域。

背景技术

猪为六畜之首，养猪业在世界尤其是中国国民经济中占有重要地位。猪肉在诸多肉类产品中的比重一直保持在三分之一左右，是人们比较喜爱的副食之一。人们的生活不断改善，传统的养殖技术已经不能满足人们对猪肉的需求量。随着现代育种技术的发展，猪的生产性能显著提高，猪的健康养殖和育肥就显得格外重要。然而猪活体背膘厚不仅关系到种猪的选育、生猪的生长发育、死亡率，而且还直接影响后期育肥效果。背膘厚度直接反应猪脂肪含量的高低，对于校正到同一个体重标准下的猪群，背膘厚度数值越大，则瘦肉率越低，骨骼肌含量越少，效益越低。因此，如何有效的降低猪活体校正背膘厚，是每个猪场经营者及育种学家追求的目标。

随着分子生物学的发展，分子标记辅助选择在猪育种中发挥越来越重要的作用，大大加快了育种进程。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是育种中运用较多的分子标记方法。

Smad(mothers against decapentaplegic-like protein)家族存在于细胞质中，它最初是在研究果蝇BMP配体突变的时候发现的。Smad作为TGF-β受体激酶的底物存在，Smad家族主要可以分为3类：抑制型(inhibitory Smads，I-Smads)、激活型(receptor-regulated Smads，R-Smads)、公共介导型(common patrner Smads，Co-Smads)。SMAD7(Smadfamily member 7)是Smad家族成员之一，属于抑制型在人当中定位于染色体18q21，长度为3111bp。SMAD7蛋白是TGF-β(transforming growth factor-β)转化生长因子的抑制物，竞争性抑制R-Smads的磷酸化，从而发挥它对TGF-β的信号通路的抑制作用。还有研究初步表明SMAD7可能与转录因子协作加强MyoD的功能影响肌肉增殖分化。SMAD7主要是作为一个抑制因子调节TGF-β-SMAD2/3通路。SMAD7通过直接结合在受体复合物的胞质尾区阻止SMAD2/3不被TGF-βI型受体(ALK5)磷酸化，从而SMAD7发挥了抑制了SMAD2/3和SMAD4复合物的形成作用。

发明内容

本发明的一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定猪活体背膘厚性状的方法。

本发明提供的鉴定或辅助鉴定猪活体背膘厚性状的方法是检测猪个体的基因型是CC基因型还是TT基因型还是CT基因型，根据所述猪个体的基因型确定所述猪活体背膘厚：TT基因型的猪个体的活体背膘厚高于CC基因型的猪个体或CT基因型的猪个体；

所述CC基因型为SMAD7基因第四外显子第244位脱氧核糖核苷酸为C的纯合体；

所述CT基因型为SMAD7基因第四外显子第244位脱氧核糖核苷酸为C和T的杂合体；

所述TT基因型为SMAD7基因第四外显子第244位脱氧核糖核苷酸为T的纯合体。

上述方法中，所述检测猪个体的基因型是CC基因型还是TT基因型还是CT基因型为如下A)或B)：

A)直接测序猪个体的SMAD7基因；

B)测序含有SMAD7基因第四外显子的第244位脱氧核糖核苷酸的PCR扩增产物；

所述PCR扩增产物所用的引物为如下1)或2)：