[发明专利]一种牡蛎疱疹病毒不同变异株的巢式PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 201610052695.7 申请日: 2016-01-26
公开(公告)号: CN105543415A 公开(公告)日: 2016-05-04
发明(设计)人: 白昌明;王崇明;高文辉;汪清晨;史杰;张庆利 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 代理人: 曾庆国
地址: 266071 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 牡蛎 疱疹病毒 不同 变异 pcr 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种检测牡蛎疱疹病毒的巢式PCR引物组,其特征在于,所述的 引物组的信息如下:

Pol-F:5'-GATTTCAACTCGCAATACC-3'、

Pol-R:5'-GGCAGACACAGATTCCACA-3'、

nPol-F:5'-GTGTTTCTACATTGCTGG-3'、

nPol-R:5'-CTGTTGGCGTTGACCTTC-3'。

2.权利要求1所述的巢式PCR引物组在制备检测牡蛎疱疹病毒的制 品中的应用。

3.一种检测牡蛎疱疹病毒的方法,其特征在于,所述的方法使用权 利要求1所述的巢式PCR引物组。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的方法首先从待检 测样品中制备反应模板,并配制巢式PCR反应体系,然后通过巢式PCR 反应程序对反应模板进行扩增,最后根据PCR产物琼脂糖凝胶电泳是否产 生目的条带对检测结果进行判断,如果显示目的条带则表示该样品的牡蛎 疱疹病毒检测结果为阳性。

5.如权利要求4所述的方法,包含有如下的步骤:

1)基因组DNA提取:采用普通动物组织的DNA提取方法,从待检 测的样品中提取DNA;

2)第一轮PCR扩增:

以步骤1)中得到的样本DNA为模板,采用Pol-F/Pol-R引物,经PCR 扩增得到第一轮PCR扩增产物;

3)第二轮PCR扩增:

以第一轮PCR扩增产物10倍稀释物为模板,采用nPol-F/nPol-R引 物,经PCR扩增得到第二轮PCR扩增产物;

4)PCR扩增产物检测:

取第二轮PCR扩增产物进行电泳,如存在386bp的特异性条带,则 确定所检测的样本被OsHV-1所感染。

6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤2)所用PCR 反应体系为:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)4.0μL,Mg2+(25mmol/L)4.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超纯水30.6μL补齐到50μL的反应体 系。

7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤2)所用PCR 反应程序为:首先94℃预变性5min;然后94℃变性30s,53℃变性30 s,72℃延伸45s,35个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。

8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)所用PCR 反应体系为:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)3.0μL,Mg2+(25.0mmol/L)3.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超纯水32.6μL补齐到50μL的反应体 系。

9.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)所用PCR 反应程序为:首先94℃预变性5min;然后94℃变性30s,51℃变性30 s,72℃延伸45s,25个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。

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