[发明专利]一种牡蛎疱疹病毒不同变异株的巢式PCR检测方法在审
| 申请号: | 201610052695.7 | 申请日: | 2016-01-26 |
| 公开(公告)号: | CN105543415A | 公开(公告)日: | 2016-05-04 |
| 发明(设计)人: | 白昌明;王崇明;高文辉;汪清晨;史杰;张庆利 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 曾庆国 |
| 地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 牡蛎 疱疹病毒 不同 变异 pcr 检测 方法 | ||
1.一种检测牡蛎疱疹病毒的巢式PCR引物组,其特征在于,所述的 引物组的信息如下:
Pol-F:5'-GATTTCAACTCGCAATACC-3'、
Pol-R:5'-GGCAGACACAGATTCCACA-3'、
nPol-F:5'-GTGTTTCTACATTGCTGG-3'、
nPol-R:5'-CTGTTGGCGTTGACCTTC-3'。
2.权利要求1所述的巢式PCR引物组在制备检测牡蛎疱疹病毒的制 品中的应用。
3.一种检测牡蛎疱疹病毒的方法,其特征在于,所述的方法使用权 利要求1所述的巢式PCR引物组。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述的方法首先从待检 测样品中制备反应模板,并配制巢式PCR反应体系,然后通过巢式PCR 反应程序对反应模板进行扩增,最后根据PCR产物琼脂糖凝胶电泳是否产 生目的条带对检测结果进行判断,如果显示目的条带则表示该样品的牡蛎 疱疹病毒检测结果为阳性。
5.如权利要求4所述的方法,包含有如下的步骤:
1)基因组DNA提取:采用普通动物组织的DNA提取方法,从待检 测的样品中提取DNA;
2)第一轮PCR扩增:
以步骤1)中得到的样本DNA为模板,采用Pol-F/Pol-R引物,经PCR 扩增得到第一轮PCR扩增产物;
3)第二轮PCR扩增:
以第一轮PCR扩增产物10倍稀释物为模板,采用nPol-F/nPol-R引 物,经PCR扩增得到第二轮PCR扩增产物;
4)PCR扩增产物检测:
取第二轮PCR扩增产物进行电泳,如存在386bp的特异性条带,则 确定所检测的样本被OsHV-1所感染。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤2)所用PCR 反应体系为:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)4.0μL,Mg2+(25mmol/L)4.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超纯水30.6μL补齐到50μL的反应体 系。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤2)所用PCR 反应程序为:首先94℃预变性5min;然后94℃变性30s,53℃变性30 s,72℃延伸45s,35个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。
8.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)所用PCR 反应体系为:DNA聚合酶(5U/μL)0.4μL,10×PCRbuffer5.0μL,dNTPs (2.5mmol/L)3.0μL,Mg2+(25.0mmol/L)3.0μL,上下游引物(10.0μmol/L) 各2.0μL,DNA模板2.0μL,另外加超纯水32.6μL补齐到50μL的反应体 系。
9.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤3)所用PCR 反应程序为:首先94℃预变性5min;然后94℃变性30s,51℃变性30 s,72℃延伸45s,25个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。
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