[发明专利]一种基于深度学习的代谢质谱筛查方法及系统有效
申请号: | 201610049879.8 | 申请日: | 2016-01-25 |
公开(公告)号: | CN105718744B | 公开(公告)日: | 2018-05-29 |
发明(设计)人: | 纪震;周家锐;殷夫;朱泽轩 | 申请(专利权)人: | 深圳大学;纪震;周家锐;殷夫;朱泽轩 |
主分类号: | G06N3/08 | 分类号: | G06N3/08 |
代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 | 代理人: | 王永文;刘文求 |
地址: | 518060 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 代谢 质谱 筛查 质谱数据库 整合 学习 样本 判定 网络 疾病 | ||
1.一种基于深度学习的代谢质谱筛查方法,其特征在于,包括步骤:
A、获得训练样本数据集S={S
B、对S中的每个质谱进行预处理得到代谢质谱特征数据集T={T
C、构造类标集合为C=[C
D、将预处理后的代谢质谱特征数据集T={T
E、构造包含1个输入层,1个输出层,以及L个隐含层的深度学习网络结构,其中输入层具有2D个节点,输出层具有K个节点,对于任意第
F、使用栈式自编码器分别训练各隐含层;
G、使用逻辑回归作为输出层节点的激活函数,逐一训练输出层的节点;
H、在对各层分别进行训练后,依次栈式叠加,构成代谢质谱筛查深度学习网络;
I、使用BP算法对代谢质谱筛查深度学习网络的网络参数进行整体微调;
J、在训练完成后,将代谢质谱筛查深度学习网络用于代谢质谱样本的并行检测与筛查。
2.根据权利要求1所述的基于深度学习的代谢质谱筛查方法,其特征在于,在步骤J中,对于新输入的代谢质谱样本s,先进行预处理,获得特征矢量T,而后送入代谢质谱筛查深度学习网络进行并行预测,获得对应的输出状态矢量为O。
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