[发明专利]一组用于肠癌早期诊断的NDRG4基因甲基化检测引物和探针及其试剂盒有效
申请号: | 201610048731.2 | 申请日: | 2016-01-23 |
公开(公告)号: | CN105543378A | 公开(公告)日: | 2016-05-04 |
发明(设计)人: | 邹鸿志;吴珊;牛智通;赵荣淞;余浩 | 申请(专利权)人: | 广州市康立明生物科技有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 任重 |
地址: | 510655 广东省广州市天*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 肠癌 早期 诊断 ndrg4 基因 甲基化 检测 引物 探针 及其 试剂盒 | ||
1.一组用于肠癌早期诊断的NDRG4基因甲基化检测引物和探针,其特征在于,所述引物 为NDRG4-1FP和NDRG4-1RP,其核苷酸序列分别如SEQIDNO.1和2所示;所述探针为NDRG4- 2Pb,其核苷酸序列如SEQIDNO.3所示。
2.一种用于肠癌早期诊断的NDRG4基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂 盒包含有权利要求1所述引物NDRG4-1FP、NDRG4-1RP和探针NDRG4-2Pb。
3.根据权利要求2所述检测试剂盒,其特征在于,还包括利用引物NDRG4-1FP、NDRG4- 1RP和探针NDRG4-2Pb进行PCR扩增时,获得PCR模板所需试剂,所需试剂包括提取待测样品 DNA时捕获目的片段的捕获探针NDRG4-CP,捕获探针NDRG4-CP的核苷酸序列如SEQIDNO.4 所示。
4.根据权利要求2所述检测试剂盒,其特征在于,所述引物NDRG4-1FP、NDRG4-1RP和探 针NDRG4-2Pb的使用浓度均为50~500μM。
5.根据权利要求2所述检测试剂盒,其特征在于,还包括利用引物NDRG4-1FP、NDRG4- 1RP和探针NDRG4-2Pb进行PCR扩增时,PCR扩增体系试剂,包括dNTP、镁离子、反应缓冲液、 酶、无核酸酶的水。
6.根据权利要求5所述检测试剂盒,其特征在于,所述体系试剂包括5~20mM的dNTP、10 ~40mM的镁离子、1×~10×反应缓冲液、酶、无核酸酶的水。
7.根据权利要求5所述检测试剂盒,其特征在于,利用该试剂盒进行NDRG4基因甲基化 检测时,PCR体系中各组分的反应终浓度如下:
正向引物0.1~2μM
反向引物0.1~2μM
探针0.1~1μM
dNTP0.1~2mM
镁离子2~10mM
反应缓冲液1×反应体系总体积
酶0.1U~0.6U/μL
无核酸酶的水1×反应体系总体积。
8.根据权利要求5所述检测试剂盒,其特征在于,所述酶为热启动聚合酶。
9.根据权利要求2所述检测试剂盒,其特征在于,利用该试剂盒进行NDRG4基因甲基化 检测时,PCR程序如下:
95℃300s;1个循环;
95℃20s,62℃30s,70℃30s;10个循环;
95℃20s,58℃60s,72℃30s;30~40个循环;
37℃30s;1个循环。
10.根据权利要求3所述检测试剂盒,其特征在于,所述待测样品为粪便,所需试剂还包 括粪便预处理试剂,预处理试剂为研磨缓冲液。
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