[发明专利]一种杆菌自动扫描筛选系统及方法在审
| 申请号: | 201610018556.2 | 申请日: | 2016-01-12 |
| 公开(公告)号: | CN105675558A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
| 发明(设计)人: | 刘炳宪;谢菊元;王焱辉;王克惠;徐春锋 | 申请(专利权)人: | 宁波江丰生物信息技术有限公司 |
| 主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 朱俊跃 |
| 地址: | 315400 浙江省宁*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 杆菌 自动 扫描 筛选 系统 方法 | ||
技术领域
本发明涉及显微扫描技术,尤其涉及一种杆菌自动扫描筛选系统及方法。
背景技术
数字切片病理扫描仪是用于将传统的玻璃病理切片通过全自动显微镜或 光学放大系统扫描采集以获得高分辨率数字图像。数字切片病理扫描仪主要 应用在医疗,制药等领域。在医疗中以扫描结核杆菌的痰涂片为例:实际诊 断时需要在40倍物镜下观察50个视野,再统计在这50个视野中所看到的杆 菌数量,最终给出诊断结果。结核杆菌的痰涂片由于要求暗场观察,随机取 50个视野进行数字化扫描,容易出现遗漏;而且40倍物镜景深较小,用40 倍物镜制作焦平面时误差较大,扫描图像不清晰,为了扫描图像能够清晰不 影响杆菌筛选识别,通常采用增加扫描层数的手段提高清晰度,但扫描速度 慢,诊断效率低。
发明内容
针对现有的数字切片病理扫描仪在扫描杆菌时存在的上述问题,现提供 一种旨在实现扫描精度高,速度快的杆菌自动扫描筛选系统及方法。
具体技术方案如下:
一种杆菌自动扫描筛选系统,包括:
一第一扫描单元,用于在暗场环境下采用扫描镜头以第一放大倍数扫描 待扫描切片,获取第一扫描图像;
一第一获取单元,连接所述第一扫描单元,用以根据所述第一扫描图像 的清晰度获取一焦平面;
一筛选单元,连接所述第一扫描单元,用以根据第一预设规则筛选出所 述第一扫描图像中有杆菌的区域;
一第二扫描单元,分别连接所述第一获取单元和所述筛选单元,所述第 二扫描单元用于在暗场环境下以所述焦平面为基准采用扫描镜头以第二放大 倍数扫描所述第一扫描图像中有杆菌的区域,以获取第二扫描图像;
一识别单元,连接所述第二扫描单元,用以根据第二预设规则识别所述 第二扫描图像的扫描结果。
优选的,所述第一放大倍数为20倍。
优选的,所述第二放大倍数为40倍。
优选的,所述第一预设规则为判断所述第一扫描图像是否有符合预设的 第一亮度指标及第一形状识别参数的杆菌图像,所述第一形状识别参数包括 杆菌的面积、长度、宽度、周长和纵横比。
优选的,所述第二预设规则为根据预设的第二亮度指标和第二形状识别 参数识别所述第二扫描图像的扫描结果,所述第二形状识别参数包括杆菌的 面积、长度、宽度、周长和纵横比。
一种杆菌自动扫描筛选方法,应用如上述的杆菌自动扫描筛选系统,包 括下述步骤:
S1.在暗场环境下采用扫描镜头以第一放大倍数扫描待扫描切片,获取 第一扫描图像;
S2.根据所述第一扫描图像的清晰度获取一焦平面;
S3.根据第一预设规则筛选出所述第一扫描图像中有杆菌的区域;
S4.在暗场环境下以所述焦平面为基准采用扫描镜头以第二放大倍数扫 描所述第一扫描图像中有杆菌的区域,以获取第二扫描图像;
S5.根据第二预设规则识别所述第二扫描图像的扫描结果。
优选的,所述第一放大倍数为20倍。
优选的,所述第二放大倍数为40倍。
优选的,所述第一预设规则为判断所述第一扫描图像是否有符合预设的 第一亮度指标及第一形状识别参数的杆菌图像,所述第一形状识别参数包括 杆菌的面积、长度、宽度、周长和纵横比。
优选的,所述第二预设规则为根据预设的第二亮度指标和第二形状识别 参数识别所述第二扫描图像的扫描结果,所述第二形状识别参数包括杆菌的 面积、长度、宽度、周长和纵横比。
上述技术方案的有益效果:
1)杆菌自动扫描筛选系统采用第一扫描单元进行粗扫描,并获取焦平面, 通过第二扫描单元在第一扫描单元获取的扫描图像的基础上根据焦平面进行 高精度扫描,以获取扫描结果,无需增加扫描层数,针对性强,扫描时间短, 准确性高;
2)杆菌自动扫描筛选方法先进行粗扫描,再根据粗扫描获取的扫描图像 及焦平面进行二次高精度扫描,避免了扫描过程中遗漏视野的情况,用时短 且效率高。
附图说明
图1为本发明所述的杆菌自动扫描筛选系统的一种实施例的模块图;
图2为本发明所述的杆菌自动扫描筛选方法的一种实施例的方法流程 图。
具体实施方式
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