[发明专利]一种鉴定黄鳝物种及其产品的方法

说明书

本发明提供了一个黄鳝特有基因以及利用该基因鉴别黄鳝物种的方法。通过对黄鳝全基因组的深度测序发现了一个黄鳝物种特异的基因（EEL000313.2）。基于该基因序列信息设计引物，通过DNA提取、PCR扩增和凝胶电泳步骤可特异性扩增该基因（EEL000313.2）。本发明可以实现经济、快速且高效的鉴别黄鳝物种，有助于黄鳝的科研和培育，规范黄鳝肉类销售市场。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种鉴定黄鳝物种及其产品的方法及专用片段与引物。

背景技术

黄鳝是天然性逆转动物, 属于淡水硬骨鱼类，合鳃鱼目，合鳃鱼科。黄鳝在出生初期，即从胚胎期到初次性成熟时都是雌性（即体长在35厘米以下的个体的生殖腺全为卵巢）。在排卵之后，雌性性腺逐渐凋亡，雄性性腺逐渐发育，卵巢逐渐变为精巢；在经历一个特殊的时期——兼性阶段（体长约为36～48厘米）以后，就会发育成完全的雄性（体长53厘米以上者则多为雄性）。整个性逆转的发育过程是单向的，完成性逆转的雌性个体不会再次发生性逆转过程。黄鳝这种天然的性逆转的现象，使得黄鳝成为了一个研究性别决定和性别发育的良好的模式物种，也使其在生物学、医学和农业上具有巨大的研究价值和经济效益。

黄鳝肉嫩味鲜，营养价值甚高。鳝鱼中含有丰富的DHA和卵磷脂，它是构成人体各器官组织细胞膜的主要成分，而且是脑细胞不可缺少的营养。故食用鳝鱼肉有补脑健身的功效。它所含的特种物质“鳝鱼素”，有清热解毒、凉血止痛、祛风消肿、润肠止血等功效，能降低血糖和调节血糖，对痔疮、糖尿病有较好的治疗作用，加之所含脂肪极少，因而是糖尿病患者的理想食品。鳝鱼含有的维生素A量高得惊人。维生素A可以增进视力，促进皮膜的新陈代谢。黄鳝不仅被当作名菜用来款待客人，近年来活运出口，畅销国外，更有冰冻鳝鱼远销美洲等地。黄鳝一年四季均产，但以小暑前后者最为肥美，民间有“小暑黄鳝赛人参”的说法。

但是由于黄鳝养殖较为困难且多以经验为主，黄鳝肉价格较高，因此市场上有部分假冒黄鳝肉进行销售，严重影响公民饮食健康。目前尚未有通过分子生物学方法鉴定黄鳝肉质的方法报道。

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。全基因组测序的方法是先提取基因组DNA，然后随机打断，电泳回收所需长度的DNA片段（0.2~5Kb），加上接头, 进行基因簇cluster制备或电子扩增E-PCR，最后利用Paired-End（Solexa）或者Mate-Pair（SOLiD）的方法对插入片段进行测序。然后对测得的序列组装成Contig，通过Paired-End的距离可进一步组装成Scaffold，进而可组装成染色体等。组装效果与测序深度与覆盖度、测序质量等有关。常用的组装有：SOAPdenovo、Trimity、Abyss等。迄今尚未见关于黄鳝全基因组测序的相关文献。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的缺点与不足，提供一种鉴定黄鳝物种的方法。

本发明提供的方法，为检测待测对象的基因组DNA，若基因组DNA中含有目的DNA分子，则所述待测对象为黄鳝。

所述目的DNA分子为Seq NO.1，外显子个数为1个，位置是chr5： 28889163-28889999。

为实现上述目的，本发明通过对天然性逆转的硬骨鱼类黄鳝基因组进行测序，获得了黄鳝基因组框架草图，得到了基因组50倍的序列，ScaffoldN50为967kb,组装Scaffold为683M。进一步，我们通过基因组数据分析比较不同物种之间基因表达的差异筛选出黄鳝物种特异基因Seq NO.1，并由此确定和验证候选基因。通过NCBI网站blast搜索结果如图1，在其他物种中无任何同源基因。

上述检测待测对象的基因组DNA的方法为测序、PCR或分子杂交；

所述待测对象的基因组DNA来源于离体的待测对象的组织器官或血液。