[发明专利]宫颈癌的生物标记物有效
| 申请号: | 201580063278.6 | 申请日: | 2015-09-21 |
| 公开(公告)号: | CN107002136B | 公开(公告)日: | 2021-09-21 |
| 发明(设计)人: | 海斯贝塔·巴伦蒂娜·阿莉达·维斯曼;阿特·赫拉德·扬·范德泽;爱德华杜斯·玛丽亚·多米尼克斯·斯胡林 | 申请(专利权)人: | 格罗宁根大学;格罗宁根医学医院 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 张英;宫传芝 |
| 地址: | 荷兰格*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 宫颈癌 生物 标记 | ||
1.用于标记基因的基因特异性引物和用于所述标记基因的基因特异性探针在制备用于在分离的样品中确定宫颈细胞为肿瘤细胞或倾向于瘤变的试剂中的用途,所述确定包括测定标记基因的组的甲基化状态,其中,所述标记基因组包含以下标记基因的组合中的至少一种:
JAM3/CDH6;ANKRD18CP/CDH6/EPB41L3;GFRA1/EPB41L3/CDH6;CDH6/EPB41L3;JAM3/EPB41L3/ANKRD18CP;C13ORF18/JAM3/ANKRD18CP;GFRA1/EPB41L3/ANKRD18CP;ANKRD18CP/EPB41L3;C13ORF18/CDH6;JAM3/GFRA1/ANKRD18CP;GFRA1/CDH6;JAM3/ANKRD18CP;JAM3/EPB41L3/GFRA1;GFRA1/EPB41L3;C13ORF18/JAM3/GFRA1;JAM3/GFRA1;和C13ORF18/ANKRD18CP。
2.根据权利要求1所述的用途,包括测定以下标记基因的组中的一组的基因的甲基化状态:
JAM3/ANKRD18CP;JAM3/C13ORF 8/ANKRD18CP;和JAM3/GFRA1/ANKRD18CP。
3.根据权利要求1所述的用途,所述确定包括测定所述标记基因是否为高甲基化的。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述确定允许以至少65%的灵敏度和/或特异性检测CIN2或更高级别的(CIN2+)宫颈癌。
5.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述确定允许以至少70%的灵敏度和/或特异性检测CIN2或更高级别的(CIN2+)宫颈癌。
6.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述基因的甲基化状态使用甲基化特异性PCR(MSP)进行测定。
7.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述基因的甲基化状态使用定量甲基化特异性PCR(QMSP)进行测定。
8.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述甲基化状态使用一组引物和探针进行测定,所述引物由选自表1A的条目5至10的序列组成,所述探针由选自表1B的条目19至21的序列组成。
9.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述样品是宫颈刮片,或者其中,所述样品是液基细胞学样品。
10.根据权利要求1至3中任一项所述的用途,其中所述样品是自采集的阴道拭子,或者其中,所述样品是液基细胞学样品。
11.一种试剂盒,用于在分离的样品中确定宫颈细胞为肿瘤细胞或倾向于瘤变的用途,所述试剂盒包括用于标记基因的以下组合中的至少一种的基因特异性引物:
JAM3/CDH6;ANKRD18CP/CDH6/EPB41L3;GFRA1/EPB41L3/CDH6;CDH6/EPB41L3;JAM3/EPB41L3/ANKRD18CP;C13ORF18/JAM3/ANKRD18CP;GFRA1/EPB41L3/ANKRD18CP;ANKRD18CP/EPB41L3;C13ORF18/CDH6;JAM3/GFRA1/ANKRD18CP;GFRA1/CDH6;JAM3/ANKRD18CP;JAM3/EPB41L3/GFRA1;GFRA1/EPB41L3;C13ORF18/JAM3/GFRA1;JAM3/GFRA1;和C13ORF18/ANKRD18CP,并且其中所述引物中的至少一种由选自表1A的条目5至10的序列组成。
12.根据权利要求11所述的试剂盒,其中,所述瘤变是宫颈瘤变(CIN2/3)。
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