[发明专利]部分裂解和测定的方法

说明书

与相关申请的交叉引用

本申请要求于2014年9月17日提交的美国临时申请序列号62/051,672的权益和优先权，所述临时申请的内容通过引用以其整体结合到本文中。

发明领域

本发明涉及用于处理样品用于细胞形态学筛选和筛查分子组分二者的方法。

背景

Papanicolaou (Pap)检验是一种广泛使用的宫颈筛查方法，其检测宫颈和子宫内膜细胞中的异常，包括癌前和癌病变。由于其简单、微创和便宜，Pap检验被广泛使用。该检验通常涉及使用采集装置自宫颈取得细胞样品，和测定细胞的某些指示人类乳头状瘤病毒(HPV)存在情况的诊断特征。宫颈异常的早期检测对有效治疗是必要的，并且自其在1955年引入以来在美国定期Pap筛查已将年度死亡数减少60%以上(National Cancer Institute (国家癌症研究所))。

为了获取宫颈样品，临床医生通常使用刷子或刮勺自宫颈和宫颈内管采集细胞。然后将试样直接涂抹在玻璃载玻片上(即，常规“Pap涂片”)，或采集至液基细胞学培养基(LBC)中。伴随LBC，将采集装置浸入保藏培养基中，例如从Hologic, Inc. (Bedford, MA)可得的ThinPrep® PreservCyt®溶液，并搅拌以释放细胞至培养基中。暴露于LBC培养基固定细胞，使它们能够评估细胞形态学。有用的LBC培养基的更大细节可见于美国专利申请号6,531,317，其通过引用以其整体结合到本文中。

当前的医护标准为固定一部分采集的细胞在载玻片上用于评估细胞形态学。载玻片可通过手工制备(“Pap涂片”)，然而优良的结果可用自动化系统获得，例如Hologic’s ThinPrep® Pap检验与ThinPrep®成像系统相组合。由于改善的准确度和增加的疾病检测，该方法学优于常规Pap涂片(引用- Surveillance, Epidemiology, and End Results (SEER) Program(监测、流行病学和最终结果（SEER）计划). SEER Database: Incidence – SEER 9 Regs Public-Use, Nov. 2004 Sub (1973-2002), National Cancer Institute (国家癌症研究所)，DCCPS，Surveillance Research Program, Cancer Statistics Branch (监测研究计划，癌症统计学分支), 2005年4月发布，基于2004年11月的提交)。一旦细胞固定，可筛查样品的非典型鳞状细胞、低级鳞状上皮内病变、高级鳞状上皮内病变、鳞状细胞癌、非典型腺细胞、腺癌和其它细胞学异常。参见，例如，Bethesda System for Reporting Cervical Cytology (用于报告宫颈细胞学的Bethesda系统)。

基因筛查技术的最新进展已使得可能筛查指示癌症或感染的基因变化。例如，宫颈样品可采集并筛查用于使用基因测定例如杂交测定、多重PCR或直接测序分子诊断。样品可针对基因标志数据库筛查通过分型HPV-16、HPV-18、HPV-31、HPV-33、HPV-35、HPV-39、HPV-45、HPV-51、HPV-52、HPV-56、HPV-58、HPV-68、HPV-73或HPV-82以鉴定妇女的宫颈癌风险。筛查可基于DNA、RNA或其一些组合。用于诊断筛查HPV的商业系统从Hologic, Inc.可得，例如，Cervista^® HPV或APTIMA^® HPV测定。

尽管在美国宫颈筛查的医护标准依旧为Pap检验，但美国食品药品监督管理局最近为基因检验单独用于筛查妇女宫颈癌开辟了道路。然而，团体例如American Medical Women’s Association (美国医学妇女协会)已对单独基因检验而没有同时进行形态学筛查将导致当那些妇女仅仅为HPV携带者并且不具有发展宫颈癌的直接风险时太多妇女接受治疗表示关心。参见“FDA approves Roche Genetic Test as an Alternative to Pap Smear for Cervical Cancer Screening (FDA批准罗氏基因检验作为Pap涂片替代用于宫颈癌筛查),” Associated Press，2014年4月24日，其通过引用以其整体结合到本文中。