[发明专利]用于评价化学放射线疗法对鳞状细胞癌的有效性的方法

说明书

技术领域

本发明涉及用于评价化学放射线疗法(chemoradiotherapy)对鳞状细胞癌的有效性的方法、或用于该方法的试剂。

背景技术

鳞状细胞癌是扁平复层上皮等的基底细胞呈恶性化的，其主要可见于食道癌、头颈部癌、子宫颈部癌、肺癌等中。

关于此，就食道癌而言，在东亚的黄种人中，鳞状细胞癌占90％以上，即使在欧美的白种人中，鳞状细胞癌也比腺上皮癌(另一类型的食道癌)更多。这两种癌症、即鳞状细胞癌和腺上皮癌从病理组织及发展系谱来看均是不同的癌症。但是，这两种食道癌目前却被施以相同的治疗，作为病期为II、III期局部进展癌的标准治疗方法，在日本为术前辅助性化学疗法(CT，chemotherapy)和根治性化学放射线疗法(CRT，chemoradiotherapy)；在欧美为术前辅助性化学放射线疗法。采用根治性CRT的五年生存率为50％左右，比术前CT的五年生存率(55％)稍低，但其能够保留器官，对于高龄的患者和约占10％的并发胃癌或头颈部癌的患者而言是非常有效的。因此，能在治疗前预测并选择出术前CRT有效的患者是非常令人期望的。

作为对如上所述的治疗方法的有效性进行评价的方法，在乳腺癌、大肠癌等中，有利用活检的基因表达谱的方法，尤其是逐渐发现亚型(subtype)分类法是有效的。

在食道癌中，虽然也正在尝试鉴定在临床上有用的亚型，但腺癌的样本数多，要对鳞状细胞癌的CRT敏感性亚型进行鉴定时，用于分析的样本的数量少，而且样本中的病期也不一致(非专利文献1～6，需要说明的是，非专利文献1～6中所分析的食道鳞状细胞癌的样本数分别为33、2、26、21、7及0)。因此，无法获得能对局部进展期癌的预测医疗有所贡献的确切可靠的结果，尚未开发出能对鳞状细胞癌的化学放射线疗法的敏感性、预后加以预测的方法。

现有技术文献

非专利文献

非专利文献1：Ashida A.等，国际肿瘤学杂志(Int J Oncology)，2006年，第28卷，1345-1352页

非专利文献2：Luthra R.等，临床肿瘤学杂志(Journal of Clinical Oncology)，2006年，第24卷，259-267页

非专利文献3：Greenawalt.等，国际癌症杂志(Int J Cancer)，2007年，第120卷，1914-1921页

非专利文献4：Duong C.等，肿瘤外科年鉴(Ann Surg Oncol)，2007年，第14卷，3602-3609页

非专利文献5：Maher SG.等，外科学年鉴(Ann Surg)，2009年，第250卷，729-737页

非专利文献6：Kim SM.等，Plos one，2010年，5：e15074

发明内容

发明所要解决的课题

本发明是鉴于上述现有技术中存在的课题而作出的，其目的在于提供能够高精度地评价化学放射线疗法对鳞状细胞癌的有效性(对敏感性、预后加以预测)的方法及试剂。

用于解决课题的手段

为了达成上述目的，本申请的发明人利用基于全局基因表达谱的无监督聚类分析，进行了对鳞状细胞癌的与进行化学放射线疗法(CRT)治疗的预后相关的亚型的鉴定。结果发现，可以将鳞状细胞癌重现性良好地分类为高度表达特定的基因探针集(gene probe set)的5种病例簇(cluster)(亚型)。并且，本申请的发明人发现，在这5种亚型中，属于亚型-7的病例为预后良好组，而另一方面，属于亚型-5的病例为预后不良组。

进而，在亚型-7中，针对控制高度表达的基因群组表达的转录因子，通过对在每个病例中的表达量的相关性分析进行了探索，结果寻找到了SIM2基因。另外，在亚型-5中也进行了同样的探索，结果发现，控制该亚型的基因群组表达的转录因子为FOXE1。而且，鉴定出了决定对CRT为敏感性的亚型-7的基因，即，SIM2基因及与该基因共表达的基因(191个基因)，还鉴定出了决定对CRT为非敏感性的亚型-5的基因，即FOXE1基因及与该基因共表达的基因(121个基因)。