[发明专利]用于生物合成化合物的方法、试剂和细胞

权利要求书

1.在重组宿主中生成5-氨基戊酸的方法，所述方法包括：

使用具有脱羧酶活性的多肽在所述重组宿主中将赖氨酸酶促转化为尸胺；并且

使用具有氧化酶活性的多肽在所述重组宿主中将尸胺酶促转化为5-氨基戊酸。

2.在重组宿主中生成5-氨基戊酸的方法，所述方法包括：

使用具有单加氧酶活性的多肽在所述重组宿主中将赖氨酸酶促转化为5-氨基戊酰胺；并且

使用具有酰胺酶活性的多肽在所述重组宿主中将5-氨基戊酰胺酶促转化为5-氨基戊酸。

3.在重组宿主中生成5-氨基戊酸的方法，所述方法包括：

在所述重组宿主中使用具有ω-转氨酶活性的多肽将尸胺酶促转化为5-氨基戊醛；并且

在所述重组宿主中使用具有醛脱氢酶活性的多肽将5-氨基戊醛酶促转化为5-氨基戊酸。

4.权利要求3的方法，其中使用具有脱羧酶活性的多肽在所述重组宿主中从赖氨酸酶促生成尸胺。

5.权利要求1至4中任一项的方法，所述方法还包括将5-氨基戊酸酶促转化为选自戊二酸，5-羟基戊酸酯和1,5戊二醇的产物。

6.权利要求5的方法，其中使用一种或多种具有转氨酶，脱氢酶或羧酸还原酶活性的多肽将5-氨基戊酸转化为所述产物。

7.权利要求1或4的方法，其中所述具有脱羧酶活性的多肽与SEQ ID NO:1、16、17或18所示的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

8.权利要求1或4的方法，其中所述具有脱羧酶活性的多肽分类在EC 4.1.1.-下。

9.权利要求1的方法，其中所述具有氧化酶活性的多肽与SEQ ID NO:21所示的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

10.权利要求1的方法，其中所述具有氧化酶活性的多肽分类在EC 1.4.3.21下。

11.权利要求2的方法，其中所述具有单加氧酶活性的多肽与SEQ ID NO:20所示的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

12.权利要求2的方法，其中所述具有单加氧酶活性的多肽分类在EC 1.13.12.2下。

13.权利要求2的方法，其中所述具有酰胺酶活性的多肽与SEQ ID NO:19所示的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

14.权利要求2的方法，其中所述具有酰胺酶活性的多肽分类在EC 3.5.1.30下。

15.权利要求3的方法，其中所述具有ω-转氨酶活性的多肽与SEQ ID NO:8至13中任一项所示的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

16.权利要求3的方法，其中所述具有ω-转氨酶活性的多肽分类在EC 2.6.1.-下。

17.权利要求3的方法，其中所述具有醛脱氢酶活性的多肽分类在EC 1.2.1.3或EC 1.2.1.4下。

18.权利要求1至17中任一项所述的方法，其中通过发酵进行所述方法的一个或多个步骤。

19.权利要求18的方法，其中使用陶瓷膜保留所述宿主以在发酵期间维持高细胞密度。

20.权利要求1至19中任一项的方法，其中所述宿主经受在需氧，厌氧，微需氧或混合氧/反硝化培养条件下的培养策略。

21.权利要求1至20中任一项的方法，其中在磷酸盐，氧和/或氮限制的条件下培养所述宿主。

22.权利要求18的方法，其中供给所述发酵的主要碳源源自生物或非生物原料。

23.权利要求22的方法，其中所述生物原料是或源自单糖，二糖，木质纤维素，半纤维素，纤维素，木质素，乙酰丙酸，甲酸，甘油三酯，甘油，脂肪酸，农业废物，浓缩酒糟(condensed distillers’solubles)，或城市废物。