[发明专利]检测ALDH2基因多态性的引物、探针和试剂盒在审

专利信息
申请号: 201510870281.0 申请日: 2015-12-01
公开(公告)号: CN105441439A 公开(公告)日: 2016-03-30
发明(设计)人: 胡利红;吴志伟;夏琦;段卫涛;赵平锋 申请(专利权)人: 武汉海吉力生物科技有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 北京汇泽知识产权代理有限公司 11228 代理人: 程殿军;张瑾
地址: 430000 湖北省武汉市东湖技术*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 检测 aldh2 基因 多态性 引物 探针 试剂盒
【权利要求书】:

1.检测ALDH2基因多态性的引物和探针,其特征在于,探针为公用的Taqman探针,其核苷酸序列5’端标记报告基团,3’端标记淬灭基团;引物的核苷酸序列如下:

突变型ARMS上游引物:SEQIDNO:1;

野生型ARMS上游引物:SEQIDNO:2;

公用的下游引物:SEQIDNO:3。

2.根据权利要求1所述的检测ALDH2基因多态性的引物和探针,其特征在于,探针的核苷酸序列如SEQIDNO:4所示,5’端标记的报告基团为FAM,3’端标记的淬灭基团为MGB。

3.一种检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的检测ALDH2基因多态性的引物和探针。

4.根据权利要求3所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,还包括内控引物和内控Taqman探针,核苷酸序列如下:

内控上游引物:SEQIDNO:5;

内控下游引物:SEQIDNO:6;

内控Taqman探针:SEQIDNO:7;

内控Taqman探针的核苷酸序列5’端标记报告基团,3’端标记淬灭基团。

5.根据权利要求4所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,内控Taqman探针的核苷酸序列标记的报告基团为JOE,淬灭基团为BHQ1。

6.根据权利要求4所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,还包括阳性质控品,阳性质控品为含有ALDH2G1510A野生型基因序列、G1510A突变型基因序列以及内控基因序列的DNA混合物,内控基因序列如SEQIDNO:8所示。

7.根据权利要求6所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的试剂分为四类:

(1)ALDH2基因突变型检测液:至少含有SEQIDNO:1、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液;

(2)ALDH2基因野生型检测液:至少含有SEQIDNO:2、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液;

(3)阳性质控品;

(4)DNA聚合酶。

8.根据权利要求6所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的试剂分为三类:

(1)ALDH2基因突变型检测液:至少含有SEQIDNO:1、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液,ABI公司的产品FastmasterPremix;

(2)ALDH2基因野生型检测液:至少含有SEQIDNO:2、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液,ABI公司的产品FastmasterPremix;

(3)阳性质控品。

9.权利要求6~8任一所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括:

(1)用内控引物及内控Taqman探针扩增阳性对照品,结果显示JOE信号CT值小于25,表示试剂盒可用;

(2)将待检样品DNA分别用突变型引物和公用Taqman探针,以及野生型引物和公用Taqman探针进行荧光定量PCR反应并获得对应的突变型CT值和野生型CT值,△Ct=|野生型CT值-突变型CT值|≤2.5为杂合型样本,△Ct=野生型CT值-突变型CT值>2.5为突变型样本,△Ct=突变型CT值-野生型CT值>2.5为野生型样本。

10.根据权利要求9所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒的使用方法,其特征在于,荧光定量PCR反应条件为:

第一阶段:95℃4min;

第二阶段:95℃5s,58℃30s,10个循环;

第二阶段:95℃30s,58℃30s,72℃30s,35个循环;

信号收集:第三阶段72℃时收集FAM和JOE信号。

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