[发明专利]检测ALDH2基因多态性的引物、探针和试剂盒在审
申请号: | 201510870281.0 | 申请日: | 2015-12-01 |
公开(公告)号: | CN105441439A | 公开(公告)日: | 2016-03-30 |
发明(设计)人: | 胡利红;吴志伟;夏琦;段卫涛;赵平锋 | 申请(专利权)人: | 武汉海吉力生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京汇泽知识产权代理有限公司 11228 | 代理人: | 程殿军;张瑾 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖技术*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 aldh2 基因 多态性 引物 探针 试剂盒 | ||
1.检测ALDH2基因多态性的引物和探针,其特征在于,探针为公用的Taqman探针,其核苷酸序列5’端标记报告基团,3’端标记淬灭基团;引物的核苷酸序列如下:
突变型ARMS上游引物:SEQIDNO:1;
野生型ARMS上游引物:SEQIDNO:2;
公用的下游引物:SEQIDNO:3。
2.根据权利要求1所述的检测ALDH2基因多态性的引物和探针,其特征在于,探针的核苷酸序列如SEQIDNO:4所示,5’端标记的报告基团为FAM,3’端标记的淬灭基团为MGB。
3.一种检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1或2所述的检测ALDH2基因多态性的引物和探针。
4.根据权利要求3所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,还包括内控引物和内控Taqman探针,核苷酸序列如下:
内控上游引物:SEQIDNO:5;
内控下游引物:SEQIDNO:6;
内控Taqman探针:SEQIDNO:7;
内控Taqman探针的核苷酸序列5’端标记报告基团,3’端标记淬灭基团。
5.根据权利要求4所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,内控Taqman探针的核苷酸序列标记的报告基团为JOE,淬灭基团为BHQ1。
6.根据权利要求4所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,还包括阳性质控品,阳性质控品为含有ALDH2G1510A野生型基因序列、G1510A突变型基因序列以及内控基因序列的DNA混合物,内控基因序列如SEQIDNO:8所示。
7.根据权利要求6所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的试剂分为四类:
(1)ALDH2基因突变型检测液:至少含有SEQIDNO:1、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液;
(2)ALDH2基因野生型检测液:至少含有SEQIDNO:2、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液;
(3)阳性质控品;
(4)DNA聚合酶。
8.根据权利要求6所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒,其特征在于,试剂盒中的试剂分为三类:
(1)ALDH2基因突变型检测液:至少含有SEQIDNO:1、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液,ABI公司的产品FastmasterPremix;
(2)ALDH2基因野生型检测液:至少含有SEQIDNO:2、SEQIDNO:3的引物和核苷酸序列为SEQIDNO:4的探针,以及内控引物和内控Taqman探针,dNTPs,PCR缓冲液,ABI公司的产品FastmasterPremix;
(3)阳性质控品。
9.权利要求6~8任一所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括:
(1)用内控引物及内控Taqman探针扩增阳性对照品,结果显示JOE信号CT值小于25,表示试剂盒可用;
(2)将待检样品DNA分别用突变型引物和公用Taqman探针,以及野生型引物和公用Taqman探针进行荧光定量PCR反应并获得对应的突变型CT值和野生型CT值,△Ct=|野生型CT值-突变型CT值|≤2.5为杂合型样本,△Ct=野生型CT值-突变型CT值>2.5为突变型样本,△Ct=突变型CT值-野生型CT值>2.5为野生型样本。
10.根据权利要求9所述的检测ALDH2基因多态性的试剂盒的使用方法,其特征在于,荧光定量PCR反应条件为:
第一阶段:95℃4min;
第二阶段:95℃5s,58℃30s,10个循环;
第二阶段:95℃30s,58℃30s,72℃30s,35个循环;
信号收集:第三阶段72℃时收集FAM和JOE信号。
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