[发明专利]一种用于竹节参分子鉴定的引物及序列特异扩增区域(SCAR)的方法在审
| 申请号: | 201510724704.8 | 申请日: | 2015-10-29 |
| 公开(公告)号: | CN105349534A | 公开(公告)日: | 2016-02-24 |
| 发明(设计)人: | 袁丁;张长城;刘朝奇;王婷;周志勇;何毓敏;许成;李菁 | 申请(专利权)人: | 三峡大学 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 宜昌市三峡专利事务所 42103 | 代理人: | 蒋悦 |
| 地址: | 443002*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 竹节参 分子 鉴定 引物 序列 特异 扩增 区域 scar 方法 | ||
1.一种用于竹节参分子鉴定的引物,其特征在于,所述的引物为Z1,其序列为:F5’-AGACGTCCACATGGGCTA-3’;R5’-TAGACGTCCACGTTAAGTTAG-3’。
2.采用权利要求1所述的特异性引物Z1进行竹节参序列特异性扩增区域(SCAR)标记分子的鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:
基因组DNA的提取:用液氮将研钵、大小杵,药匙预冷,称取200mg叶片和10%PVP(W/W)置于液氮中,迅速研磨成细粉;将研磨好的细粉转移至1.5mL离心管中,迅速加入4℃预冷的700μL去多糖buffer,混匀,在冰上静置30min,4℃3000r·min-1离心5min,弃上清,此步骤重复一次,弃上清,加入700μL65℃预热的2×CTAB提取液,65℃水浴40min,每隔10min轻轻上下颠倒混匀一次,取出1.5mL离心管,冷却至室温,12000r·min-1离心10min;取上清,加入等体积的氯仿:异戊醇的混合液,混匀10min,12000r·min-1离心10min,取上清,重复此步骤一次,取上清至新的1.5mL离心管,加入0.6倍体积的-20℃预冷的异丙醇,混匀,于-20℃静置1h,4℃12000r·min-1离心10min,沉淀用70%乙醇洗涤2次,无水乙醇洗涤1次,用吹风机冷风吹干液体,干燥后,加入30μL灭菌ddH2O和0.5μLRNaseA,37℃水浴1h,于-20℃保存备;
SCAR分析:应用特异性SCAR引物Z1对竹节参及其它人参属植物基因组DNA进行PCR扩增,其中,特异性SCAR引物Z1序列为:F5’-AGACGTCCACATGGGCTA-3’;R5’-TAGACGTCCACGTTAAGTTAG-3’;SCAR-PCR反应体系为:模板DNA1μL,2×TaqPCRMastermix12.5μL,上下游引物各1μL,加灭菌ddH2O补齐至25μL,其中,上下游引物浓度均为10mmol/L;SCAR-PCR扩增程序为94℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,循环34次;72℃补充延伸5min,取PCR反应产物20μL,在100V电压下,经1.5%琼脂糖凝胶(含GelRed)电泳30min,GeneGenius凝胶分析系统检测照相,即可完成竹节参的序列特异性扩增区域(SCAR)标记分子的鉴定。
3.权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,SCAR-PCR反应体系为:模板DNA1μL,2×TaqPCRMastermix12.5μL,上下游引物各1μL,加灭菌ddH2O补齐至25μL,其中,上下游引物浓度均为10mmol/L。
4.权利要求2所述的鉴定方法,其特征在于,SCAR-PCR扩增程序为94℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,循环34次;72℃补充延伸5min。
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