[发明专利]一种用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统及方法

权利要求书

1.一种用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统，其特征在于，所述用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统包括：

疾病亚型获取模块，用于根据用户输入的疾病关键词，从MeSH网站中爬取与输入的疾病关键词相关的疾病亚型列表，并将取得的疾病亚型列表和输入的关键词保存；

疾病亚型阈值设置模块，用于根据疾病亚型获取模块中取得的疾病亚型列表，选择其中需要研究的疾病亚型，并为其设置阈值，设置完成后保存；

基因与疾病相关性分析模块，用于根据疾病亚型阈值设置模块中设置了阈值的疾病亚型列表，从CoreMine医学信息检索平台数据库中取得疾病的Significance值小于阈值的基因列表并保存；

种子基因生成模块，用于根据基因与疾病相关性分析模块中得到的基因和DiseaseConnect数据库中的基因组合，形成种子基因列表，并保存；

数据筛选模块，用于根据从String9.1数据库中取得的蛋白表和基因蛋白表中的蛋白进行比对，将蛋白表中的蛋白置换为对应的基因，并根据输入的边值，筛选出符合条件的基因，形成相应的基因表并保存；

区间划分模块，用于根据数据筛选模块中保存的基因表，以及输入的模块筛选区间范围，使用经典社区划分算法BGLL算法，对基因表中的基因进行划分，形成模块基因关系表，并保存；

富集分析模块，用于根据区间划分模块中得到的模块基因关系表，使用拓扑分析算法，对种子基因和各个模块进行富集分析，得到富集分析结果并保存；

疾病靶点获取模块，用于根据种子基因生成模块中得到的种子基因列表，与DrugBank数据库中的基因列表进行比对，查找出在DrugBank数据库中存在的基因列表即为疾病靶点列表，并保存；

疾病药物列表生成模块，用于根据疾病亚型获取模块中保存的疾病关键词，使用网络爬虫技术，从DrugBank数据库中爬取获得药品的链接列表，打开每个药品的链接，在网页中爬取药品相关的信息和药品对应的靶点信息，形成药品信息和靶点信息列表并保存；

潜在药物靶点生成模块，用于根据疾病药物列表生成模块中得到的药品和靶点列表以及疾病靶点获取模块中保存的疾病靶点列表进行比对，如果疾病靶点列表中的基因不在疾病药物的基因列表中，则判断该靶点是否在该靶点对应模块的Pathway中P值最小的基因列表中，如果是，则该靶点为潜在靶点，否则为非潜在靶点。

2.如权利要求1所述的用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统，其特征在于，所述疾病亚型获取模块，用于获取用户输入的疾病关键词，将查询疾病关键词的请求通过网络爬虫算法转发到远程MeSH服务器中，MeSH服务器从MeSH数据库中查询和疾病相关的疾病亚型，并将查询的结果返回；疾病亚型获取模块分析MeSH服务器返回的结果，进而获取和疾病相关的疾病亚型列表。

3.如权利要求1所述的用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统，其特征在于，所述疾病亚型阈值设置模块，用于获取疾病亚型获取模块中得到的疾病亚型列表，选择其中需要研究的疾病亚型，并为其设置阈值；设置阈值针对每个疾病亚型进行单独设置，或为所有的疾病亚型统一设置；每个疾病亚型的阈值默认值为0.05，设置完成后，保存每个疾病亚型的阈值。

4.如权利要求1所述的用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统，其特征在于，所述基因与疾病相关性分析模块，用于根据疾病亚型阈值设置模块中设置了阈值的疾病亚型列表，从CoreMine医学数据库中查找出所有Significance值小于阈值的基因，并将符合条件的基因保存到数据库中。

5.如权利要求1所述的用于复杂大脑疾病靶向组合治疗分析的系统，其特征在于，所述种子基因生成模块，用于根据基因与疾病相关性分析模块中得到的疾病亚型和基因列表，将每个疾病亚型的基因列表与DiseaseConnect数据库中的相关基因做并集处理，生成合并后的每个疾病亚型的种子基因列表，并将各基因列表保存到数据库中。