[发明专利]检测烟草冷杉醇合成关键基因NtCPS2单核苷酸突变的特异引物及检测方法有效
| 申请号: | 201510686117.4 | 申请日: | 2015-10-14 |
| 公开(公告)号: | CN105177162B | 公开(公告)日: | 2018-12-14 |
| 发明(设计)人: | 常爱霞;王元英;王国平;刘旦;杨爱国;孙惠青;曹建敏;李义强;罗成刚;冯全福;刘贯山 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院烟草研究所;中国烟草中南农业试验站 |
| 主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
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| 地址: | 266101 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 烟草 冷杉 合成 关键 基因 ntcps2 核苷酸 突变 特异 引物 方法 | ||
1.一种检测烟草冷杉醇合成关键基因NtCPS2单核苷酸突变的检测方法,包括以下步骤:
S1,根据烟草冷杉醇合成关键基因NtCPS2的第四号外显子cDNA序列,基于AS-PCR原理,在SNP突变处设计两个上游引物,使引物的3′末端核苷酸与SNP位点一致,同时在引物3′末端倒数第三位人工引入错配碱基T,在第四号外显子末端设计一个公用的下游引物,这样构成的两对引物形成互补引物,能够相互检测SNP的类型,同时也能够检测后代为杂合体或纯合体;
两个上游引物CPS2-1F和CPS2-2F以及公用下游引物CPS2-R:
上游引物CPS2-1F 5′-3′:ACAGATGAAAGGTTTGATAG
上游引物CPS2-2F 5′-3′:ACAGATGAAAGGTTTGATAT
下游引物CPS2-R 5′-3′:TCTCTTATGAAGGCACGTGT;
NtCPS2的第四号外显子序列:
S2,提取被检测烟草品种的DNA;
S3,以被检测烟草品种的DNA为模板,使用NtCPS2基因特异性引物对被检测烟草品种的DNA进行PCR扩增;
S4,采用电泳检测PCR扩增产物,判断PCR扩增产物是否含有292bp的特征条带:
如果引物对CPS2-1F/CPS2-R有条带,而引物对CPS2-2F/CPS2-R无条带,则被检测烟草品种为正常纯合型G,有冷杉醇合成;
反之,则被检测烟草品种为突变纯合型T,不合成冷杉醇;
如果这两对引物都有扩增条带,则说明检测品种为杂合型。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,PCR扩增的反应体系组成为:2×Dreamtaq MIX 10uL,模板DNA 1ul,上游引物1uL,下游引物1uL,最后用双蒸水将反应体系补至20uL。
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