[发明专利]辅助大肠癌的再发风险诊断的计算机系统、程序及方法有效
| 申请号: | 201510621189.0 | 申请日: | 2015-09-25 |
| 公开(公告)号: | CN105468893B | 公开(公告)日: | 2019-06-21 |
| 发明(设计)人: | 后藤健吾;吉田雄一郎;大友泰裕 | 申请(专利权)人: | 希森美康株式会社 |
| 主分类号: | G16H50/30 | 分类号: | G16H50/30 |
| 代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 郑天松 |
| 地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 辅助 肠癌 再发 风险 诊断 计算机系统 程序 方法 | ||
1.大肠癌的再发风险的判断中使用的计算机系统,其具备含处理器和存储器的计算机,在上述存储器中记录有使在上述计算机中实行下列工序的计算机程序:
接收下列基因的表达量的接收工序:
从自大肠癌患者采集的活体样品中的含C18orf22、C18orf55、CCDC68、CNDP2、CYB5A、LOC400657、LOC440498、MBD2、MBP、MYO5B、NARS、PQLC1、RTTN、SEC11C、SOCS6、TNFRSF11A、TXNL1、TXNL4A、VPS4B及ZNF407的第1基因组中的全部基因,
从自大肠癌患者采集的活体样品中的含ASXL1、C20orf112、C20orf177、CHMP4B、COMMD7、CPNE1、DIDO1、DNAJC5、KIF3B、NCOA6、PHF20、PIGU、PLAGL2、POFUT1、PPP1R3D、PTPN1、RBM39、TAF4及TCFL5的第2基因组中的全部基因,以及
从自大肠癌患者采集的活体样品中的含ANGPTL2、AXL、C1R、C1S、CALHM2、CTSK、DCN、EMP3、GREM1、ITGAV、KLHL5、MMP2、RAB34、SELM、SRGAP2P1及VIM的第3基因组中的全部基因,
基于接收的上述表达量,判断上述患者的大肠癌的再发风险的判断工序,
其中在上述判断工序中,
当上述第3基因组是高表达时,判断为再发风险高,
当上述第1基因组是低表达、且上述第3基因组是低表达时,判断为再发风险为中度,
当上述第1基因组是高表达,上述第2基因组是高表达、且上述第3基因组是低表达时,判断为再发风险为中度,
当上述第1基因组是高表达,上述第2基因组是低表达、且上述第3基因组是低表达时,判断为再发风险低。
2.权利要求1所述的计算机系统,其中
上述存储器存储高风险组的表达量、中风险组的表达量及低风险组的表达量,
上述处理器:
实行上述接收工序,
自上述存储器读取上述高风险组的表达量、上述中风险组的表达量及上述低风险组的表达量,
比较上述接收工序中接收的表达量和上述高风险组的表达量,
比较上述接收工序中接收的表达量和上述中风险组的表达量,
比较上述接收工序中接收的表达量和上述低风险组的表达量,
将上述活体样品的再发风险分类为相关最高的风险组,
上述高风险组的表达量
是显示
选自上述第1基因组的多个基因、
选自上述第2基因组的多个基因、及
选自上述第3基因组的多个基因
的表达量的值,
是自被判断为再发风险高的患者组的活体样品预先测定的值,
上述中风险组的表达量
是显示
选自上述第1基因组的多个基因、
选自上述第2基因组的多个基因、及
选自上述第3基因组的多个基因
的表达量的值,
是自被判断为再发风险中度的患者组的活体样品预先测定的值,
上述低风险组的表达量
是显示
选自上述第1基因组的多个基因、
选自上述第2基因组的多个基因、及
选自上述第3基因组的多个基因
的表达量的值,
是自被判断为再发风险低的患者组的活体样品预先测定的值。
3.权利要求2所述的计算机系统,其中上述处理器:
算出在上述接收工序中接收的表达量和上述高风险组的表达量的相关系数,
算出在上述接收工序中接收的表达量和上述中风险组的表达量的相关系数,
算出在上述接收工序中接收的表达量和上述低风险组的表达量的相关系数,
将上述活体样品的再发风险分类为相关系数最高的风险组。
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