[发明专利]豌豆抗白粉病等位基因er1-7的Indel标记及其应用在审
| 申请号: | 201510599010.6 | 申请日: | 2015-09-18 |
| 公开(公告)号: | CN105154442A | 公开(公告)日: | 2015-12-16 |
| 发明(设计)人: | 孙素丽;朱振东;邓东;王仲怡;李银萍;段灿星;武小菲;王晓鸣 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
| 地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 豌豆 白粉病 等位基因 er1 indel 标记 及其 应用 | ||
1.与豌豆抗白粉病基因er1-7共分离的Indel标记,其特征在于,用于扩增所述Indel标记的引物具有如下核苷酸序列:
InDel111-120-F:GGAGTTAAGGAACGAACTTTGG;
InDel111-120-R:CCATGTCTGCGTCTGTATCTTT;
所述引物扩增的与豌豆抗白粉病基因er1-7共分离的Indel标记特征条带为183bp,核苷酸序列如SeqIDNo.3所示。
2.用于筛选包含豌豆抗白粉病基因er1-7的豌豆种质资源的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的Indel标记引物;
所述Indel标记引物的核苷酸序列如下:
InDel111-120-F:GGAGTTAAGGAACGAACTTTGG;
InDel111-120-R:CCATGTCTGCGTCTGTATCTTT;
所述引物扩增的与豌豆抗白粉病基因er1-7共分离的Indel标记特征条带为183bp,核苷酸序列如SeqIDNo.3所示。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括进行PCR反应和/或电泳所需的试剂;
所述PCR反应所需的试剂包括:dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、标准阳性模板、双蒸水和/或PCRMasterMix;
所述电泳所需的试剂包括:TE缓冲液、聚丙烯酰胺、琼脂糖、四甲基乙二胺、甲醛、硝酸银。
4.权利要求2或3任一所述的试剂盒的制备方法,其特征在于,组装试剂盒的试剂中包括所述Indel标记引物;
所述Indel标记引物的核苷酸序列如下:
InDel111-120-F:GGAGTTAAGGAACGAACTTTGG;
InDel111-120-R:CCATGTCTGCGTCTGTATCTTT。
5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于,组装试剂盒的试剂中还包括PCR反应和/或电泳所需的试剂;
所述PCR反应所需的试剂包括:dNTPs、TaqDNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液、标准阳性模板、双蒸水和/或PCRMasterMix;
所述电泳所需的试剂包括:TE缓冲液、聚丙烯酰胺、琼脂糖、四甲基乙二胺、甲醛、硝酸银。
6.权利要求1所述Indel标记或权利要求2-3任一所述试剂盒在鉴定包含豌豆抗白粉病基因er1-7的豌豆种质资源方面的应用,包括如下步骤:
(1)采用所述Indel标记引物对待测豌豆材料的基因组DNA进行PCR扩增;所述Indel标记引物的核苷酸序列如下:
InDel111-120-F:GGAGTTAAGGAACGAACTTTGG;
InDel111-120-R:CCATGTCTGCGTCTGTATCTTT;
(2)对扩增结果进行电泳检测;
(3)从电泳结果中筛选出与豌豆抗白粉病基因er1-7共分离的Indel标记特征条带一致的材料;
所述与豌豆抗白粉病基因er1-7共分离的Indel标记特征条带为183bp,核苷酸序列如SeqIDNo.3所示。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为:豌豆基因组DNA2ng/μl,2×PCRMasterMix0.4μl/μl,上下游引物各0.2μmol/L,其余为双蒸水。
8.根据权利要求6或7所述的应用,其特征在于,所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性5分钟;以94℃30秒,45℃-63℃30秒,72℃30秒为1个循环,35个循环;72℃10分钟。
9.根据权利要求6-8任一所述的应用,其特征在于,所述电泳检测指,采用6%的聚丙烯酰胺凝胶或者3.5%的琼脂糖凝胶,于120V恒功率电泳分离,最后银染显色。
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