[发明专利]一种检测VHL基因突变的方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201510585409.9 申请日: 2015-09-15
公开(公告)号: CN105087808A 公开(公告)日: 2015-11-25
发明(设计)人: 龚侃;彭双鹤;李腾;王江宜;宁向辉 申请(专利权)人: 北京大学第一医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京元本知识产权代理事务所 11308 代理人: 秦力军
地址: 100034 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 vhl 基因突变 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种检测VHL基因突变的方法,其特征在于,包括:

利用VHL基因的三个外显子VHL-1、VHL-2和VHL-3的扩增引物对4-6对待测样本进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测,获得所述DNA溶液中是否存在点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测结果;

利用杂交探针对所述待测样本进行VHL基因大片段缺失的检测,获得待测样本是否存在大片段缺失的检测结果;

其中,所述杂交探针上标有荧光信号,由具有SEDIDNO.1-6所示的碱基序列的探针引物进行PCR制备得到的。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述扩增引物对4-6如SEQIDNO.7-12所示,包括:

扩增引物对4:VHL-1F5’-ggtggtctggatcgcgga-3’

VHL-1R5’-ggcttcagaccgtgctatcg-3’

扩增引物对5:VHL-2F5’-gtggctctttaacaacctttgc-3’

VHL-2R5’-cctgtacttaccacaacaaccttatc-3’

扩增引物对6:VHL-3F5’-gcaaagcctcttgttcgttc-3’

VHL-3R5’-caaaaatgccaccaccttct-3’。

3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,利用VHL基因的三个外显子VHL-1、VHL-2和VHL-3的扩增引物对4-6对待测样本进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测包括:

利用所述扩增引物对4-6和待测样本建立PCR扩增反应体系,进行PCR反应,获得PCR产物;

将得到的PCR产物进行纯化处理和测序分析,判断所述DNA是否发生了VHL基因点突变、小片段缺失或插入和剪切位点突变。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用杂交探针对所述待测样本进行VHL基因大片段缺失的检测包括:

利用已采集的待测样本制备细胞涂片;

将所述杂交探针置于杂交液中与所述细胞发生杂交反应,获得杂交产物;

洗涤所述杂交产物,并进行细胞核染色处理,获得核染色后的细胞涂片;

通过荧光显微镜观察所述核染色后的细胞涂片,判断待测样本是否发生了基因大片段缺失。

5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述制备细胞涂片的步骤包括:

分离所述样本中的细胞,经磷酸盐缓冲液洗涤和KCl低渗处理后,用固定液固定所述细胞的形态,制成细胞涂片;

将所述细胞涂片进行老化处理,经胃蛋白酶消化处理后,进行酒精梯度脱水,得到细胞涂片。

6.一种用于快速检测VHL基因突变的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的如SEDIDNO.1-6所示的碱基序列的探针引物制备得到的杂交探针。

7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,还包括:

用于进行PCR直接测序法对所述DNA溶液进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测,获得所述DNA溶液中是否存在点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的试剂盒I;

用于进行荧光原位杂交法对所述DNA溶液进行VHL基因大片段缺失的检测,获得待测样本的DNA是否存在大片段缺失的试剂盒II。

8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒I包括:用于进行PCR反应的PCRmix和如SEQIDNO.7-12所示的扩增引物。

9.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒II包括:

用于将待测样本制备成细胞涂片的试剂;

用于使所述荧光原位杂交探针与所述细胞发生杂交反应,获得杂交产物的试剂;

用于洗涤所述杂交产物,进行细胞核染色处理,获得核染色的细胞涂片的试剂。

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