[发明专利]一种检测VHL基因突变的方法及试剂盒在审
| 申请号: | 201510585409.9 | 申请日: | 2015-09-15 |
| 公开(公告)号: | CN105087808A | 公开(公告)日: | 2015-11-25 |
| 发明(设计)人: | 龚侃;彭双鹤;李腾;王江宜;宁向辉 | 申请(专利权)人: | 北京大学第一医院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京元本知识产权代理事务所 11308 | 代理人: | 秦力军 |
| 地址: | 100034 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 vhl 基因突变 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测VHL基因突变的方法,其特征在于,包括:
利用VHL基因的三个外显子VHL-1、VHL-2和VHL-3的扩增引物对4-6对待测样本进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测,获得所述DNA溶液中是否存在点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测结果;
利用杂交探针对所述待测样本进行VHL基因大片段缺失的检测,获得待测样本是否存在大片段缺失的检测结果;
其中,所述杂交探针上标有荧光信号,由具有SEDIDNO.1-6所示的碱基序列的探针引物进行PCR制备得到的。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述扩增引物对4-6如SEQIDNO.7-12所示,包括:
扩增引物对4:VHL-1F5’-ggtggtctggatcgcgga-3’
VHL-1R5’-ggcttcagaccgtgctatcg-3’
扩增引物对5:VHL-2F5’-gtggctctttaacaacctttgc-3’
VHL-2R5’-cctgtacttaccacaacaaccttatc-3’
扩增引物对6:VHL-3F5’-gcaaagcctcttgttcgttc-3’
VHL-3R5’-caaaaatgccaccaccttct-3’。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,利用VHL基因的三个外显子VHL-1、VHL-2和VHL-3的扩增引物对4-6对待测样本进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测包括:
利用所述扩增引物对4-6和待测样本建立PCR扩增反应体系,进行PCR反应,获得PCR产物;
将得到的PCR产物进行纯化处理和测序分析,判断所述DNA是否发生了VHL基因点突变、小片段缺失或插入和剪切位点突变。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述利用杂交探针对所述待测样本进行VHL基因大片段缺失的检测包括:
利用已采集的待测样本制备细胞涂片;
将所述杂交探针置于杂交液中与所述细胞发生杂交反应,获得杂交产物;
洗涤所述杂交产物,并进行细胞核染色处理,获得核染色后的细胞涂片;
通过荧光显微镜观察所述核染色后的细胞涂片,判断待测样本是否发生了基因大片段缺失。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述制备细胞涂片的步骤包括:
分离所述样本中的细胞,经磷酸盐缓冲液洗涤和KCl低渗处理后,用固定液固定所述细胞的形态,制成细胞涂片;
将所述细胞涂片进行老化处理,经胃蛋白酶消化处理后,进行酒精梯度脱水,得到细胞涂片。
6.一种用于快速检测VHL基因突变的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的如SEDIDNO.1-6所示的碱基序列的探针引物制备得到的杂交探针。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,还包括:
用于进行PCR直接测序法对所述DNA溶液进行VHL基因点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的检测,获得所述DNA溶液中是否存在点突变、小片段缺失或插入、剪切位点突变的试剂盒I;
用于进行荧光原位杂交法对所述DNA溶液进行VHL基因大片段缺失的检测,获得待测样本的DNA是否存在大片段缺失的试剂盒II。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒I包括:用于进行PCR反应的PCRmix和如SEQIDNO.7-12所示的扩增引物。
9.如权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒II包括:
用于将待测样本制备成细胞涂片的试剂;
用于使所述荧光原位杂交探针与所述细胞发生杂交反应,获得杂交产物的试剂;
用于洗涤所述杂交产物,进行细胞核染色处理,获得核染色的细胞涂片的试剂。
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