[发明专利]人类X染色体20个短串联重复序列复合扩增体系及应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物技术领域，涉及人类X染色体20个短串联重复序列复合扩增体系，具体涉及利用X染色体上具有多态性的遗传标记、通过聚合酶链式反应进行复合扩增的荧光检测试剂盒，该体系可以应用于与X染色体相关的日常亲权鉴定、个体识别以及X染色体伴性遗传疾病的辅助检测。

背景技术

人类基因组STR(短串联重复序列)是以少数几个碱基为核心单位，串联重复形成的DNA遗传标记。不同种族、不同人群甚至不同个体之间的区分是通过核心单位序列和重复数的差异,这也构成了STR的遗传多态性。在基因组中,平均每15～20kb就有一个STR位点,占基因组的10％,多存在于非编码区及内含子中,重复单位为2～6bp,重复次数10～60次,片段大小在70～500bp,并按孟德尔规律呈共显性遗传。因此STR复合扩增检测技术可以广泛应用于法医个体识别、亲子鉴定等领域。

在人类的23对染色体中，其中一对为性别染色体即为X染色体和Y染色体。女性的一对X染色体在卵细胞生成的过程中可以像常染体一样发生重组，但是在男性的精子细胞生成的过程中，X染色体和Y染色体不能随意重组。父亲的X染色体只遗传给女儿，母亲的X染色体可以遗传给女儿，也可以遗传给儿子。所以X染色体这种独特的遗传方式使得其在亲权鉴定中具有特殊的应用价值。比如双亲缺失的姐妹认亲、同父异母姐妹关系鉴定、祖母-孙女关系鉴定、乱伦关系鉴定、强奸案件的鉴定以及与X染色体相关的遗传疾病的鉴定等。

与现在市面上常染色体STR试剂盒的数量相比，X-STR试剂盒的数量仅有几家可供选择，另外X染色体相关的专利数量也比较少。

现有X-STR试剂盒和X染色体相关的专利其针对的STR位点数量较少，且在遗传多态性、个体识别力和检测的准确性上有一定欠缺，因此有必要开发一种位点数量多、遗传多态性高、个体识别力强的X-STR试剂盒。

发明内容

为了克服上述缺陷，本发明的目的在于提供一种一次能检测19个X-STR基因座及Amelogenin基因座的人类X染色体20个短串联重复序列复合扩增体系，适用于使用常染体STR试剂盒难以排除亲权关系案例的检测，并且本发明荧光标记复合扩增体系检测快速、准确。

本发明的又一个目的是提供人类X染色体短串联重复序列复合扩增体系在X染色体相关的亲权鉴定、个体识别中的应用。

为了实现上述发明目的，本发明所采取的技术方案：人类X染色体短串联重复序列复合扩增体系，其特征在于，该复合扩增体系包括19对引物，可同时扩增19个STR位点：DXS6795、DXS6803、DXS6807、DXS9907、DXS7423、GATA172D05、DXS101、DXS9902、DXS7133、DXS6810、GATA31E08、DXS6800、DXS981、DXS10162、DXS6809、GATA165B12、DXS10079、DXS10135、HPRTB；

所述扩增DXS6795的上游引物序列如SEQ ID NO1所示；

所述扩增DXS6795的下游引物序列如SEQ ID NO2所示；

所述扩增DXS6803的上游引物序列如SEQ ID NO3所示；

所述扩增DXS6803的下游引物序列如SEQ ID NO4所示；

所述扩增DXS6807的上游引物序列如SEQ ID NO5所示；

所述扩增DXS6807的下游引物序列如SEQ ID NO6所示；

所述扩增DXS9907的上游引物序列如SEQ ID NO7所示；

所述扩增DXS9907的下游引物序列如SEQ ID NO8所示；

所述扩增DXS7423的上游引物序列如SEQ ID NO9所示；

所述扩增DXS7423的下游引物序列如SEQ ID NO10所示；

所述扩增GATA172D05的上游引物序列如SEQ ID NO13所示；

所述扩增GATA172D05的下游引物序列如SEQ ID NO14所示；

所述扩增DXS101的上游引物序列如SEQ ID NO15所示；

所述扩增DXS101的下游引物序列如SEQ ID NO16所示；

所述扩增DXS9902的上游引物序列如SEQ ID NO17所示；