[发明专利]一种基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒及其应用在审
| 申请号: | 201510474753.0 | 申请日: | 2015-08-06 |
| 公开(公告)号: | CN105063199A | 公开(公告)日: | 2015-11-18 |
| 发明(设计)人: | 陆兴热 | 申请(专利权)人: | 陆兴热 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 广州三环专利代理有限公司 44202 | 代理人: | 郝传鑫 |
| 地址: | 663000 云南省文山*** | 国省代码: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 ercc8 基因 检测 胃癌 感性 试剂盒 及其 应用 | ||
技术领域
本发明属于生物医疗研究领域,涉及一种疾病易感性检测用的试剂盒,具体涉及一种基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒及其应用。
背景技术
胃癌的发生与多种因素有关,其中饮食习惯,生活环境以及幽门螺杆菌的感染等均是导致胃癌发生的高危因素。遗传因素也是一项重要的方面。基因的多态性是导致疾病发生遗传以及疾病发生遗传易感性的重要方面。其中以单核苷酸多态性最为常见。
单核苷酸多态性由于是人类基因组中最为常见的多态形式,因此其可以作为人类疾病的一种特有基因。某一个或者几个的单核苷酸多态性可以代表某个单体区域的单核苷酸多态性称之为标签单核苷酸多态性。
DNA修复基因的主要作用是为了保持基因组中DNA的完整性以及其相关的稳定性。当DNA出现损伤时DNA可以有自身的修复能力。但不同个体其DNA修复能够存在有一定的差异。目前有研究表明,DNA修复基因的序列会影响DNA的修复能力。
ERCC8是转录偶联修复的核心基因,其主要是参与DNA修复过程中的转录偶联修复,并且修复氧化损伤以及与多种的重要蛋白质有着相对交互作用。ERCC8基因启动子区、编码区、内含子区均存在多个SNPs,这些SNPs可能影响到基因转录水平、剪接方式、翻译效率和蛋白质的功能等,从而影响不同个体的DNA修复的能力。因此研究ERCC8基因是有重要意义。
DNA修复基因ERCC8TagSNPs与胃癌及其癌前疾病发病风险研究(景晶晶,中国医科大,2012)中对辽宁庄河胃癌高发区进行研究发现,携带ERCC8_rs158572位点GG/AG基因型者罹患胃癌的风险增高,尤其是50岁以上男性具有更高的胃癌发病风险。
本发明通过对胃癌患者进行ERCC8基因SNPs的检测,发现了与上文报道不一致的结论。
发明内容
为解决上述问题,本发明提供了一种基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒及其用途。
第一方面,本发明提供了一种基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒,包括:检测ERCC8基因上rs158572号SNP位点的特异性引物和/或检测ERCC8基因上rs158916号SNP位点的特异性引物。
优选地,所述检测ERCC8基因上rs158572号SNP位点的特异性引物为:
SEQIDNO:5及SEQIDNO:6组成的引物对;或SEQIDNO:7及SEQIDNO:8组成的引物对。
优选地,检测ERCC8基因上rs158916号SNP位点的特异性引物为:
SEQIDNO:11及SEQIDNO:12组成的引物对。
优选地,所述检测ERCC8基因上rs158572号SNP位点的特异性引物和检测ERCC8基因上rs158916号SNP位点的特异性引物为用于多重PCR反应的多重PCR引物组,所述的多重PCR引物组为SEQIDNO:5、SEQIDNO:6、SEQIDNO:11及SEQIDNO:12组成的多重PCR引物组。
优选地,所述胃癌易感性的检测为针对云南省(优选为文山州)地区人群进行的胃癌易感性检测。
第二方面,本发明提供了一种评估人群胃癌易感性的方法,包括如下步骤:
1)采用如第一方面所述的试剂盒对待测人群的ERCC8基因rs158572号和/或rs158916号SNP位点的基因型进行检测;
2)检测待测人群是否感染幽门螺杆菌;
3)对步骤1)和2)的检测结果进行统计,并对ERCC8基因rs158572号和/或rs158916号SNP位点与幽门螺杆菌感染交互作用进行分析,获得人群胃癌易感性的评估结果。
优选地,所述步骤1)中,采用如第一方面所述的试剂盒中的多重PCR引物组进行多重PCR反应检测待测人群的ERCC8基因rs158572号和rs158916号SNP位点的基因型。
进一步优选地,每个多重PCR反应体系中采用的多重PCR引物组总浓度为12uM。
进一步优选地,所述多重PCR反应程序为:
优选地,所述的待测人群为云南省(优选为文山州)地区人群。
第三方面,本发明提供了一种如第一方面所述的基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒在检测ERCC8基因上的rs158572号和/或rs158916号SNP位点中的应用。
本发明提供的基于ERCC8基因检测胃癌易感性的试剂盒可用于准确ERCC8基因的rs158572和rs158572号SNP位点的基因型的检测。
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