[发明专利]河八王的一种DNA指纹图谱及其获取方法与专用引物

说明书

本发明提供了河八王的一种DNA指纹图谱及其获取方法与专用引物，所述获取河八王DNA指纹图谱的专用引物，包括引物对SEQ NO：1和SEQ NO：2，引物对SEQ NO：3和SEQ NO：4，引物对SEQ NO：5和SEQ NO：6。采用本发明获取河八王DNA指纹图谱的专用引物获得的河八王DNA指纹图谱的多态性高、特异性好，重复性好；谱带在100bp‑400bp之间，分布集中、均匀，特异性高，便于鉴别；构建的河八王基因组DNA指纹图谱具有唯一性，能够有效而精确的鉴别不同的河八王种质资源，将在利用河八王种质进行甘蔗遗传改良中发挥重要作用。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其涉及河八王的一种DNA指纹图谱及其获取方法与专用引物。

背景技术

甘蔗是我国最主要的糖料作物，蔗糖产量占全国食糖总产量的90％以上，在数十年“高贵化”育种进程中，甘蔗遗传基础变得逐渐狭窄。因此，加大力度利用甘蔗野生资源拓宽甘蔗遗传基础被认为是甘蔗育种获突破的关键途径之一。河八王[Narengaporphyrocoma(Hance)Bor]是河八王属(Narenga Bor)的一个野生种，又名草鞋密，具有耐瘦、耐旱、粗生、早熟、分蘖力强等优良性状。传统的育种选择是对表型性状的变异进行选择，但有些重要性状无法在早期检测出来，分子标记技术就可以利用幼苗进行DNA多态性检测，根据与目的基因相关的标记进行选择，能提高选择的准确度，缩短育种周期，提高育种效率和选择的可靠性，相当简便。

扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism，AFLP)是基于PCR技术扩增基因组DNA限制性片段，基因组DNA先用限制性内切酶切割，然后将双链接头连接到DNA片段的末端，接头序列和相邻的限制性位点序列，作为引物结合位点。它结合了RFLP和PCR技术特点，具有RFLP技术的可靠性和PCR技术的高效性。AFLP目前广泛用于植物群体遗传分析及系统发育分析研究，在更高分类水平和自然植物群体间基因漂移研究上特别有用。现有技术构建作物基因组DNA指纹图谱使用的方法主要是分子标记结合聚丙烯凝胶电泳检测法，存在着谱带数偏少，需要用到较多的引物的问题，为了有效利用河八王的丰富资源，需要建立河八王的AFLP分子标记技术体系。

发明内容

针对上述技术问题，本发明提供了河八王的一种DNA指纹图谱及其获取方法与专用引物。

对此，本发明所采用的技术方案为：

一种获取河八王DNA指纹图谱的专用引物，由引物对Narenga 1、引物对Narenga2、引物对Narenga 3组成；

所述Narenga 1是序列表的SEQ NO：1和SEQ NO：2组成的引物对；

所述Narenga 2是序列表的SEQ NO：3和SEQ NO：4组成的引物对；

所述Narenga 3是序列表的SEQ NO：5和SEQ NO：6组成的引物对。

Narenga 1：

正向引物：GAC TGC GTA CCA ATT CACG(SEQ NO：1)

反向引物：GAT GAG TCC TGA GTA ACAT(SEQ NO：2)

Narenga 2：

正向引物：GAC TGC GTA CCA ATT CACG(SEQ NO：3)

反向引物：GAT GAG TCC TGA GTA ACAG(SEQ NO：4)

Narenga 3：

正向引物：GAC TGC GTA CCA ATT CAAC(SEQ NO：5)