[发明专利]一种文昌鸡白麻表型相关分子标记及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及品种选育技术领域，具体地，涉及一种文昌鸡白麻表型相关分子标记及其应用。

背景技术

文昌鸡群体中变异丰富毛色表型，导致选育具有统一的黄麻羽表型文昌鸡纯系十分困难。选育过程中常遇到的问题是黄麻羽亲本产生具有白麻表型（企业亦称其为珍珠白）的后代。常规方法是通过测交的方法剔除携带白麻等位基因的个体，该方法缺点是（1）周期长。整个过程从杂交到根据后代表型辨别黄麻公鸡的基因型需要约45天左右；（2）无法做到100%准确。因为该方法是根据7个后代的表型来计算黄麻公鸡为某种基因型的概率，其无法做到100%准确；（3）涉及环节较多，容易出错。该方法设计人工授精、集蛋、标记种蛋、集中入孵、出孵、标记鸡苗、表型鉴别等一系列的步骤，如果其中一个步骤出错都会导致结果的不准确。

发明内容

本发明的目的是为了克服现有技术的上述不足，提供一种文昌鸡白麻表型相关分子。该分子标记可以辅助选择的方法剔除携带白麻羽等位基因的公鸡个体。

本发明的另一个目的是提供一种利用文昌鸡白麻表型相关分子标记辅助选择的方法选育黄麻羽表型文昌鸡纯系的方法。

为了实现上述目的，本发明是通过以下方案予以实现的：

一种文昌鸡白麻表型相关分子标记，所述分子标记为SLC45A2基因编码区1154bp处的G/C突变。

不同的毛色相关基因的变异导致了个体不同的毛色表型。本发明通过研究发现SLC45A2基因编码区1154bp处的G/C突变与白麻表型完全连锁，上述突变导致了对应编码蛋白385位氨基酸的Gly到Ala的变异。可能是该错义突变导致了蛋白结构发生变化，导致嗜黑素合成通路受阻，从而产生白麻表型。

如上所述的文昌鸡白麻表型相关分子标记在选育黄麻羽表型文昌鸡中的应用。

一种选育黄麻羽表型文昌鸡纯系的方法，包括如下步骤：

S1.提取待测黄麻鸡公鸡的血液DNA，以黄麻鸡公鸡血液DNA为模板、SEQ ID NO：2~3所示引物进行PCR扩增；

S2.将扩增产物直接测序，若基因型为GC型，该个体为携带白麻突变的黄麻鸡，若基因型为GG型，该个体为黄麻鸡纯合子；

S3.通过S2的结果判断，将携带白麻羽等位基因的公鸡个体剔除，从而获得黄麻羽表型文昌鸡纯系。

与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：

本发明首次发现导致文昌鸡白麻表型的致因突变，通过检测个体的上述致因突变的基因型，我们就可以知道该黄麻个体是否携带白麻表型相关的基因变异。利用该发明无需进行测交，而且准确率达100%。

将该分子标记应用到黄麻羽表型文昌鸡的选育过程中，使整个选育过程具有以下优点：

（1）周期短，速度快：从拿到待检个体血样到决定被检个体的选淘只需要2天时间，每人每天至少可以完成144个体的检测。

（2）准确率100%。由于该方法是检测与白麻表型相关的致因突变的基因型，因此该方法可以做到100%的准确。

（3）环节少，不易出错。整个过程只涉及采样和基因型分型两个步骤，因此不易出错。

附图说明

图1为覆盖突变位点的扩增序列。

图2为白麻表型文昌鸡与非白麻表型品种目的片段测序结果示意图；测序结果从上到下依次是：红色原鸡（RJ）、杏花鸡（XH）、清远麻鸡（QM）、BW（霸王山鸡）、文昌鸡黄麻表型个体（WCY）、文昌鸡白麻表型个体（WCW）、固始鸡（GS）。

具体实施方式

下面结合说明书附图和具体实施例对本发明作出进一步地详细阐述，所述实施例只用于解释本发明，并非用于限定本发明的范围。下述实施例中所使用的试验方法如无特殊说明，均为常规方法；所使用的材料、试剂等，如无特殊说明，为可从商业途径得到的试剂和材料。

实施例1

S1.引物设计

以NCBI数据库中鸡SLC45A2基因CDS序列（Genbank登录号： DQ900700.1）为参考，设计一对引物，该引物扩增得到的DNA序列如SEQ ID NO:1所示，全长244 bp，如图1所示，括号内为突变位点。引物由上海捷瑞生物科技有限公司合成。引物序列如下：

上游引物F：5’-CCTTTTGTGATTGTTGTGGT-3’；

下游引物R：5’-ACTGCTGAGAATGTAATACTTGTT-3’。

S2.筛选分子标记