[发明专利]一种大样本高通量生物数据关联分析方法有效

专利信息
申请号: 201510353906.6 申请日: 2015-06-24
公开(公告)号: CN104978497B 公开(公告)日: 2019-01-29
发明(设计)人: 李其刚;孔庆鹏 申请(专利权)人: 中国科学院昆明动物研究所
主分类号: G16B5/00 分类号: G16B5/00
代理公司: 四川君士达律师事务所 51216 代理人: 芶忠义
地址: 650223 *** 国省代码: 云南;53
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 样本 通量 生物 数据 关联 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种大样本高通量生物数据关联分析方法,其特征在于,包括:通过比较每个样本内基因间的大小关系建立每个基因的频数表,将对数似然模型应用到每个频数表计算似然值,排序似然值得到跟表型差异最相关联的基因;

所述通过比较每个样本内基因间的大小关系建立每个基因的频数表的步骤包括:对于基因 i,首先在每个样本内比较基因i和其它基因的大小关系,然后根据R、C、 S、G 4个变量计算频数,得到包含四个变量的频数表,其中,R表示大小关系,C表示肿瘤类型,S表示正常还是肿瘤样本,G表示同基因i比 较的基因;

所述将对数似然模型应用到每个频数表计算似然值的步骤包括:应用对数线性模型到基因i的频数表计算模型(S+R)*C*G的似然值, 加号代表变量间的加和效应,而星号代表变量间的加和效应和交互效应。

2.根据权利要求1所述的一种大样本高通量生物数据关联分析方法,其特征在于,所述排序似然值得到跟表型差异最相关联的基因的步骤包括: 所有的基因重复前两个步骤,降序排列所有基因的似然值得分。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国科学院昆明动物研究所,未经中国科学院昆明动物研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201510353906.6/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

同类专利
专利分类
×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top