[发明专利]提取木质纤维素厌氧发酵物料微生物DNA的方法及其成套试剂有效
| 申请号: | 201510180858.5 | 申请日: | 2015-04-16 |
| 公开(公告)号: | CN104762296B | 公开(公告)日: | 2018-12-04 |
| 发明(设计)人: | 马旭光;袁旭峰;敦越;江滔 | 申请(专利权)人: | 乐山师范学院 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
| 地址: | 614000 四川省乐山市*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 提取 木质 纤维素 发酵 物料 微生物 dna 方法 及其 成套 试剂 | ||
1.提取发酵物料中的微生物DNA的方法,包括下述步骤S1)和S2):
S1)用洗脱液洗下物料上的微生物,得到微生物洗脱液,除去所述微生物洗脱液中的杂质,得到所述微生物;
S2)提取所述微生物的DNA得到所述微生物DNA;
所述发酵物料为含木质纤维素的物质经过发酵得到的发酵产物;
所述发酵为厌氧发酵;
所述洗脱液由溶剂和溶质组成,所述溶剂为水,所述溶质及其浓度分别为8-10g/L氯化钠、0.1-0.2g/L氯化钾、0.2-0.3g/L氯化钙、0.1-0.3g/L碳酸氢钠和0.1-0.2g/L磷酸二氢钾;
所述除去所述微生物洗脱液中的杂质包括以下步骤:将所述微生物洗脱液进行离心,使微生物进入沉淀中,收集沉淀,将该沉淀命名为沉淀A1;向所述沉淀A1中加入稳定剂,得到微生物-稳定剂混合液;除去所述微生物-稳定剂混合液中的杂质,得到所述微生物;
所述稳定剂由溶剂和溶质组成,所述溶剂为水,所述溶质及其浓度分别为5-7mM Tris-HCl和2-4mM乙二胺四乙酸,所述稳定剂的pH为7.5-8.5;
所述除去所述微生物-稳定剂混合液中的杂质包括以下步骤:将所述微生物-稳定剂混合液进行离心,使微生物进入沉淀中,收集沉淀,将该沉淀命名为沉淀A2;向所述沉淀A2中加入洗涤液,得到微生物-洗涤液混合液;除去所述微生物-洗涤液混合液中的杂质,得到所述微生物;
所述洗涤液由溶剂和溶质组成,所述溶剂为水,所述溶质及其浓度分别为50-70mMTris-HCl、10-20mM EDTA、5.5-6.0g/L NaCl和10-20g/L PVP-40,所述洗涤液的pH为7.5-8.5;
所述所述微生物为吸附在发酵物料上的微生物;
所述S2)包括向所述微生物中加入成套裂解试剂,得到微生物裂解液;除去所述微生物裂解液中的杂质,得到所述微生物DNA;
所述成套裂解试剂由SDS裂解液、蛋白酶K、溶菌酶、纤维素酶、木聚糖酶和GuSCN溶液组成;所述SDS裂解液由水和溶质组成,所述溶质及其浓度分别为90-110mM Tris-HCl、30-50mM EDTA、7-7.5g/500mL NaCl、15-25g/500mL SDS和5-15g/500mL PVP-40,所述SDS裂解液的pH为7.5-8.5;所述GuSCN溶液由水和溶质组成,所述溶质及其浓度分别为90-110mMTris-HCl和55-65g/100mL异硫氰酸胍,所述GuSCN溶液的pH为6.0-6.5。
2.根据权利要求1所述的方法,所述木质纤维素为木质素和/或纤维素和/或半纤维素。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:所述发酵物料为食草动物的粪便和/或植物全株和/或植物的茎秆经过发酵得到的发酵物。
4.权利要求1-3任一所述方法在提取发酵物料中的微生物DNA中的应用;所述发酵物料为含木质纤维素的物质经过发酵得到的发酵产物;
所述发酵为厌氧发酵;
所述微生物为吸附在发酵物料上的微生物。
5.根据权利要求3或4所述的应用,其特征在于:所述木质纤维素为木质素和/或纤维素和/或半纤维素。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:所述发酵物料为食草动物的粪便和/或植物全株和/或植物的茎秆经过发酵得到的发酵物。
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