[发明专利]一种基于HBase的传染病数据管理方法有效
申请号: | 201510166304.X | 申请日: | 2015-04-10 |
公开(公告)号: | CN104794567B | 公开(公告)日: | 2018-02-23 |
发明(设计)人: | 顾君忠;相晓敏;李舒媛;张学军 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G06Q10/06;G06Q50/22;G06F17/30 |
代理公司: | 上海蓝迪专利商标事务所(普通合伙)31215 | 代理人: | 徐筱梅,张翔 |
地址: | 200241 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 hbase 传染病 数据管理 方法 | ||
1.一种基于HBase的传染病数据管理方法,其特征在于该方法包括传染病数据的存储及查询获取;所述传染病数据的存储包括传染病非结构化数据的存储和从已有的结构化数据库获取的传染病结构化数据的存储;所述传染病数据的查询获取包括传染病结构化数据的查询获取和传染病非结构化数据的查询获取;其中:
a、所述从已有的结构化数据库获取的传染病结构化数据的存储,包括以下步骤:
⑴、在HBase非结构化数据库中,建立HBase传染病非结构化存储表;
⑵、从已有的结构化数据库中,选取所有的传染病结构化数据;
⑶、采用Thrift接口,调用该接口的Tput函数读取所有的传染病结构化数据,将所有的传染病结构化数据存储到HBase传染病非结构化存储表中;
b、所述传染病非结构化数据的存储,包括以下步骤:
⑴、建立传染病非结构化数据的存储文本;
⑵、将传染病非结构化数据保存到已建立的传染病非结构化数据存储文本中;
⑶、采用Thrift接口,调用该接口的Tput函数读取存储文本,将传染病非结构化数据以key, value形式存储在HBase 传染病非结构化存储表中;
c、所述传染病结构化数据的查询获取,包括以下步骤:
⑴、采用Thrift接口,向HBase传染病非结构化存储表发送查询传染病结构化数据的查询条件;
⑵、Thrift接口调用Tget函数,查询HBase传染病非结构化存储表中与查询条件相符的传染病结构化数据并获取数据;
⑶、建立存储文本,将步骤c中⑵获取数据存储到文本中;
d、所述传染病非结构化数据的查询获取,包括以下步骤:
⑴、采用Thrift接口,向HBase传染病非结构化存储表发送传染病非结构化数据的查询条件;
⑵、调用Tget函数,查询HBase传染病非结构化存储表中与查询条件相符的传染病非结构化数据,并获取该数据;
⑶、建立存储文本,把步骤d中⑵获取的数据存储到文本中;其中:
所述传染病结构化数据为地区、年龄、性别、职业、病种、诊断医院和诊断科室的用户信息以及传染病的发病人数、死亡率、死亡人数和死亡率的疾病信息;
所述传染病非结构化数据为B超视频流、CT视频流、医学影像图片、数字病历及医生开的医院诊断报告。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述HBase传染病非结构化存储表,对于数字病历数据,采用文档数据模型,文档数据模型是基于key,value模型。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述HBase传染病非结构化存储表,对于医学影像图片数据,采用图片数据模型,具体是:
用单独的列簇存储图片内容,用其他列簇存储图片的类型、大小、创建时间、修改时间;在存储每个列簇时,会以Key,Value的方式存储每行单元格中的数据,形成若干数据块,然后把数据块保存到HFile中,最后把HFile保存到后台的HDFS。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述HBase传染病非结构化存储表,采用列式存储数据。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于所述key, value 模型的每条记录都是由主键和值两部分组成,并且不限制数据的类型。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的Thrift接口安装在Hadoop的任意结点上面,通过Java语言启动Thrift接口。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的传染病非结构化数据的查询条件为两种,一种是按指定主键获取唯一一条数据,一种是按指定列簇或者列获取一批数据。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于所述的传染病结构化数据的查询条件为两种,一种是按指定主键获取唯一一条数据,一种是按指定列簇或者列获取一批数据。
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
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G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用