[发明专利]一种构建茶树DNA指纹图谱的方法有效
申请号: | 201510089500.1 | 申请日: | 2015-02-27 |
公开(公告)号: | CN104651515A | 公开(公告)日: | 2015-05-27 |
发明(设计)人: | 孙威江;林志坤;陈志丹 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 构建 茶树 dna 指纹 图谱 方法 | ||
1.一种构建茶树DNA指纹图谱的方法,其特征在于:采用ISSR分子标记技术和二维码技术构建茶树DNA指纹图谱,将指纹图谱信息通过二维码技术处理,转化成二维码图形。
2.根据权利要求1所述的构建茶树DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述方法具体实施如下:
采用改良CTAB法提取供试茶树品种的总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳检测其浓度和纯度,并将DNA样本稀释至100 ng/uL,利用优化后的ISSR反应体系和筛选的引物对茶树DNA样本进行PCR扩增,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,分离ISSR分子标记,拍摄电泳图片;根据ISSR图谱条带的有无,对PCR扩增产物进行统计分析,将电泳图谱转换成“0-1”形式的原始字符串,利用二维码技术处理原始字符串,将原始字符串转化成为二维码图形。
3.根据权利要求2所述的构建茶树DNA指纹图谱的方法,其特征在于:所述对PCR扩增产物进行统计分析,是根据ISSR图谱条带的有无,利用人工方法统计读带,将电泳图上稳定出现的条带,无论强弱均赋值为“1”,同一位置无条带赋值为“0”, 输入读带数据,建立原始字符串。
4.根据权利要求2所述的构建茶树DNA指纹图谱的方法,其特征在于:优化后的ISSR反应体系为:在20μL体系中,Ex-Buffer用1×Ex-Buffer,1U/μL Ex-Taq酶,0.2mM/μL dNTPs,0.5mM/μL ISSR引物,2ng/μL DNA模板。
5.根据权利要求2所述的构建茶树DNA指纹图谱的方法,其特征在于:筛选的引物如SEQ ID NO.1-12所示。
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