[发明专利]一种鲑肾杆菌的检测方法在审
| 申请号: | 201510072648.4 | 申请日: | 2015-02-11 |
| 公开(公告)号: | CN104611447A | 公开(公告)日: | 2015-05-13 |
| 发明(设计)人: | 徐立蒲;王静波;王小亮;曹欢;张文;王姝;潘勇;江育林;那立海 | 申请(专利权)人: | 北京市水产技术推广站 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
| 代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 栾波 |
| 地址: | 100021 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 杆菌 检测 方法 | ||
1.一种鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)、取待检样品,并进行预处理;
2)、对预处理后的样品进行细菌核酸提取,以提取到的核酸为模板,以P3和M21为引物进行PCR扩增;
3)、以步骤2)得到的扩增片段为模板,以P4和M38为引物进行PCR扩增;
4)、将步骤2)和步骤3)得到的扩增片段分别进行琼脂糖凝胶电泳、回收以及测序后分别与如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列进行同源性比对分析;
其中,P3、M21、P4和M38的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
2.权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)中:
所述预处理包括将待检样品研磨后并加入血清体积百分含量为8-12%的199细胞培养液。
3.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)中,所述待检样品取自待检个体的肝或肾。
4.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤2)中:
所述PCR扩增的反应体系为:模板8-12μl,10Mm的dNTP1-3μl、100pmol/μl的P3 2-3μl,100pmol/μl的M21 2-3μl,25mM的MgCl29-11μl,10×PCR buffer 8-12μl,5U/μl的Taq酶1μl,DEPC水补齐至100μl。
5.根据权利要求4所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤2)中:
所述PCR扩增的反应的程序为:94℃预变性4-5min;94℃变性28-32s,60℃退火28-32s,72℃延伸60-70s,共30-35个循环。
6.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤3)中:
所述PCR扩增的反应体系为:模板4-6μl,10Mm的dNTP1-3μl、100pmol/μl的P4 2-3μl,100pmol/μl的M38 2-3μl,25mM的MgCl29-11μl,10×PCR buffer 8-12μl,5U/μl的Taq酶1μl,DEPC水补齐至100μl。
7.根据权利要求6所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤3)中:
所述PCR扩增的反应的程序为:所述PCR扩增的反应的程序为:94℃预变性4-5min;94℃变性28-32s,60℃退火28-32s,72℃延伸60-70s,共30-35个循环。
8.根据权利要求1-7任一项所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤4)中:
若步骤2)得到的扩增片段在进行琼脂糖凝胶电泳时,有特异性条带,则在步骤3)中,所述模板为将步骤2)中获得的扩增片段经过100-1000倍稀释后的片段。
9.根据权利要求1-7任一项所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤4)中:
所述琼脂糖凝胶电泳中所用的琼脂糖凝胶的浓度为1-2%,且含有0.4-0.6μg/mL的EB;所述琼脂糖凝胶电泳的电场强度为4-6V/cm,时间为0.4-0.6h。
10.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)之前,还包括:
对待检样品进行组织切片后革蓝氏染色,并于×1000的视野下进行镜检,观察所述组织切片是否含有革兰氏阳性短杆菌。
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