[发明专利]一种鲑肾杆菌的检测方法在审

专利信息
申请号: 201510072648.4 申请日: 2015-02-11
公开(公告)号: CN104611447A 公开(公告)日: 2015-05-13
发明(设计)人: 徐立蒲;王静波;王小亮;曹欢;张文;王姝;潘勇;江育林;那立海 申请(专利权)人: 北京市水产技术推广站
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01
代理公司: 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 代理人: 栾波
地址: 100021 北京市*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 杆菌 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

1)、取待检样品,并进行预处理;

2)、对预处理后的样品进行细菌核酸提取,以提取到的核酸为模板,以P3和M21为引物进行PCR扩增;

3)、以步骤2)得到的扩增片段为模板,以P4和M38为引物进行PCR扩增;

4)、将步骤2)和步骤3)得到的扩增片段分别进行琼脂糖凝胶电泳、回收以及测序后分别与如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列进行同源性比对分析;

其中,P3、M21、P4和M38的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。

2.权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)中:

所述预处理包括将待检样品研磨后并加入血清体积百分含量为8-12%的199细胞培养液。

3.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)中,所述待检样品取自待检个体的肝或肾。

4.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤2)中:

所述PCR扩增的反应体系为:模板8-12μl,10Mm的dNTP1-3μl、100pmol/μl的P3 2-3μl,100pmol/μl的M21 2-3μl,25mM的MgCl29-11μl,10×PCR buffer 8-12μl,5U/μl的Taq酶1μl,DEPC水补齐至100μl。

5.根据权利要求4所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤2)中:

所述PCR扩增的反应的程序为:94℃预变性4-5min;94℃变性28-32s,60℃退火28-32s,72℃延伸60-70s,共30-35个循环。

6.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤3)中:

所述PCR扩增的反应体系为:模板4-6μl,10Mm的dNTP1-3μl、100pmol/μl的P4 2-3μl,100pmol/μl的M38 2-3μl,25mM的MgCl29-11μl,10×PCR buffer 8-12μl,5U/μl的Taq酶1μl,DEPC水补齐至100μl。

7.根据权利要求6所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤3)中:

所述PCR扩增的反应的程序为:所述PCR扩增的反应的程序为:94℃预变性4-5min;94℃变性28-32s,60℃退火28-32s,72℃延伸60-70s,共30-35个循环。

8.根据权利要求1-7任一项所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤4)中:

若步骤2)得到的扩增片段在进行琼脂糖凝胶电泳时,有特异性条带,则在步骤3)中,所述模板为将步骤2)中获得的扩增片段经过100-1000倍稀释后的片段。

9.根据权利要求1-7任一项所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤4)中:

所述琼脂糖凝胶电泳中所用的琼脂糖凝胶的浓度为1-2%,且含有0.4-0.6μg/mL的EB;所述琼脂糖凝胶电泳的电场强度为4-6V/cm,时间为0.4-0.6h。

10.根据权利要求1所述的鲑肾杆菌的检测方法,其特征在于,在步骤1)之前,还包括:

对待检样品进行组织切片后革蓝氏染色,并于×1000的视野下进行镜检,观察所述组织切片是否含有革兰氏阳性短杆菌。

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