[发明专利]融合基因TTTY15‑USP9Y及其作为前列腺癌标志物的应用有效

专利信息
申请号: 201510067493.5 申请日: 2015-02-09
公开(公告)号: CN104611336B 公开(公告)日: 2017-06-23
发明(设计)人: 孙颖浩;任善成;朱亚生 申请(专利权)人: 上海长海医院
主分类号: C12N15/113 分类号: C12N15/113;C12Q1/68;C40B40/06
代理公司: 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙)31257 代理人: 董红曼
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 融合 基因 ttty15 usp9y 及其 作为 前列腺癌 标志 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,具体地,本发明涉及尿液长链非编码TTTY15-USP9Y及其作为前列腺癌标志物的应用。

背景技术

前列腺癌(Prostatic Cancer,PCa)是一种严重威胁男性健康的恶性肿瘤,其发病及死亡率高峰在70岁左右,占全球肿瘤发病率第二位、死亡率第六位。我国PCa的发病率近年来一直处于显著的上升趋势。在北京、上海、广州等医学、经济发达城市,PCa发病率已位于当地十大常见肿瘤之列。来自上海市疾病控制中心的资料进一步显示,PCa的发病率自2002年起已跃居男性泌尿生殖系恶性肿瘤的首位,从1990年2.6/10万上升到2009年32.23/10万,跃居男性恶性肿瘤的第5位。流行病学数据还显示,中国PCa发病率已从1993年的1.71/10万男性人口增加到2005年的7.9/10万男性人口,年增幅13%。

PCa一旦突出包膜就失去了根治手术的机会,其患者生存时间大大下降,因此,PCa的早期诊断就显得尤为重要。血清PSA检测是目前应用最为广泛的PCa早期诊断分子标志物,它的应用大大降低了PCa特异性死亡。但是,PSA是前列腺特异性而非PCa特异性分子标记物,诸如前列腺炎、良性前列腺增生等都能引起PSA的升高。在PSA的“诊断灰区”(PSA4-10ng/ml),其诊断阳性率仅为25-40%,这就导致了众多的不必要的穿刺,同时,也给穿刺患者带来了经济负担和精神负担。所以,临床上亟需找到更具敏感性和特异性的分子标志物。

发明内容

本发明的目的为提供一种前列腺癌标志物融合基因(gene-fusion)TTTY15-USP9Y及其应用,即尿液融合基因TTTY15-USP9Y作为前列腺癌标志物的应用。

在本发明的第一方面,提供了一种从尿液中分离的融合基因TTTY15-USP9Y,所述融合基因TTTY15-USP9Y序列SEQ ID NO:1所示序列的全长或其片段。本发明所检测的特异性的融合基因片段序列如SEQ ID NO:1所示,其由两个基因TTTY15(基因ID为64595;NCBI Reference Sequence:NR_001545.2;其全长序列数据库链接为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/142379120)以及基因USP9Y(基因ID:8287,NCBI Reference Sequence:NG_008311.1,其基因全长序列数据库链接为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/195228748)在转录阶段特异性地契合而成。

本发明中,所述融合基因TTTY15-USP9Y序列为SEQ ID NO:1所示序列的全长或其片段。所述片段包括融合基因TTTY15-USP9Y的任意一个PCR片段,该任意一个PCR片段为PCR反应产物,因不同的PCR引物可获得不同的PCR产物。

SEQ ID NO:1为:

CTCATCACCTGGAGTCCGTGTAAGCTCGGCGACAGCCCTAGCAGCGAGGCCAAAACAGTTTGGGAAGAAAGAAAACCTAAAGTATTTGCCGTTGGTGATTCAAGGGAATCAAACTTGACGTATGGAGCCAAGAAAGCCCTTGGAAAAACTGGCCTCATATTTTGTGTACACAGTCCCTGTACAGGGTTTCTGACCTGTGA|gagcttggagataattctggtggctgtgtggagtatgtgttggaggtattaaattttcacagtatatataaggcagcaattgataggcctttcacagattcttctgataactacataaagagacaaaaaaaagaaaaaagagcaaagatctgtgctgtgtcaagtatgacagccatcactcatggctctccagtaggagg

(其中分隔符“|”之前的片段来自TTTY15,分割后“|”之后的片段来自USP9Y)

在另一优选例中,所述融合基因TTTY15-USP9Y分离自人的尿液。

在另一优选例中,所述尿液为前列腺按摩后尿液。所述尿液还包括非前列腺按摩后尿液。

在另一优选例中,所述融合基因TTTY15-USP9Y提取自尿液离心后的尿沉渣。

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