[发明专利]用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的引物对和探针及其应用有效
申请号: | 201510035285.7 | 申请日: | 2015-01-25 |
公开(公告)号: | CN104911252A | 公开(公告)日: | 2015-09-16 |
发明(设计)人: | 龚剑;唐乃平;谈小龙;李娟 | 申请(专利权)人: | 江苏发士达生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 淮安市科文知识产权事务所 32223 | 代理人: | 谢观素 |
地址: | 223600 江苏省宿*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 艾滋病 治疗 药物 tc ftc 耐药 突变 引物 探针 及其 应用 | ||
1.用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的引物对和探针,其特征在于:包括检测HIV-1病毒RNA的pol基因的第184位、151位和65位突变位点M184V、M184I、Q151M和K65R的ARMS引物对和Taqman探针;
M184V的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列,Taqman探针为SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端;
M184I的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.2和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列,Taqman探针为SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端;
Q151M的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.5和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列,Taqman探针为SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端;
K65R的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别SEQ ID No.6和SEQ ID No.7所示的核苷酸序列,Taqman探针为SEQ ID No.9所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端。
2. 用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的引物对和探针,其特征在于:包括检测HIV-1病毒RNA的pol基因的第184位突变位点M184V、M184I的ARMS引物对和Taqman探针;
M184V的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.1和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列;
M184I的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.2和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列;
ARMS引物对的Taqman探针为SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端。
3.用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的引物对和探针,其特征在于:包括检测HIV-1病毒RNA的pol基因的第151位突变位点Q151M的ARMS引物和Taqman探针;
Q151M的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别为SEQ ID No.5和SEQ ID No.8所示的核苷酸序列,
ARMS引物对的Taqman探针为SEQ ID No.10所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端。
4.用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的引物对和探针,其特征在于:包括检测HIV-1病毒RNA的pol基因的第65位突变位点K65R 的ARMS引物和Taqman探针;
K65R的ARMS引物对的上游引物和下游引物分别SEQ ID No.6和SEQ ID No.7所示的核苷酸序列,
ARMS引物对的Taqman探针为SEQ ID No.9所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端。
5.用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的试剂盒,其特征在于:包括权利要求1至4任一项所述的ARMS引物对和探针。
6.根据权利要求5所述的用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的试剂盒,其特征在于:还包括RT-PCR 缓冲液、dNTPs、MgCl2、M-MLV逆转录酶、Taq DNA聚合酶。
7.根据权利要求6所述的用于检测艾滋病治疗药物3TC和FTC耐药突变位点的试剂盒,其特征在于:还包括模板RNA、试剂盒质控品引物对和试剂盒质控品的Taqman探针,试剂盒质控品引物对的上游序列和下游序列分别为SEQ ID No.11和SEQ ID No.12所示的核苷酸序列;试剂盒质控品的Taqman探针为SEQ ID No.13所示的核苷酸序列,分别用FAM和BHQ1标记5’端和3’端。
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