[发明专利]图像处理方法以及细胞分取方法

说明书

技术领域

本发明涉及一种图像处理方法和细胞分取方法。

背景技术

以往，已知如下一种方法：对粘接在薄板上的基板粘贴生物体组织的切片，通过薄板的伸展将基板与切片一起分割为多个小片，从薄板提取一部分小片，由此分取切片内的确定区域的细胞(例如，参照专利文献1)。在专利文献1中，从生物体组织的相邻位置切出两个切片，利用上述的方法将一方切片与基板一起分割，将另一方切片染色。而且，基于已被染色的切片的图像来决定切片内的所要提取的区域，提取与决定好的区域对应的位置的小片。

专利文献1：国际公布第2012/066827号

发明内容

发明要解决的问题

然而，在薄板上，非常多的微小的(例如，0.5mm以下的)小片以矩阵状排列。将分割前的基板和切片的图像与分割后的实际的基板和切片进行比较并从这样的小片排列中准确地确定期望的小片的位置的作业是繁杂且困难的。

本发明是鉴于上述情形而完成的，其目的在于提供一种即使是多个微小的小片进行排列的小片排列也能够易于从其中确定期望的小片的图像处理方法和细胞分取方法。

用于解决问题的方案

为了达成上述目的，本发明提供以下方法。

本发明的第一方式是一种图像处理方法，对小片排列的图像进行处理，该小片排列是将粘有生物体组织的切片的基板与所述切片一起分割为多个小片而得到的、所述小片彼此隔开间隙地二维状排列的排列，该图像处理方法包括以下工序：图像获取工序，对所述小片排列进行拍摄，获取包含已被分割的所述切片的整体的分割切片图像；小片识别工序，从在该图像获取工序中获取到的所述分割切片图像中识别所述小片的像；属性信息附加工序，对构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素的各个像素附加属性信息，该属性信息包含构成在该小片识别工序中识别出的所述小片的像的像素所归属的小片的像在所述小片排列的像中的位置的信息；以及复原工序，将包括在该属性信息附加工序中被附加了所述属性信息的像素的所述小片的像彼此接合为一个像，由此生成将所述已被分割的切片的像接合为一个像所得到的复原切片图像。

根据本发明的第一方式，在小片识别工序中识别在图像获取工序中获取到的分割切片图像内的小片的像，在复原工序中将小片的像彼此以没有间隙且不重合的方式合成为一个像，由此生成包含分割前的切片的整体像的复原切片图像。能够从复原切片图像中准确地把握切片内的组织构造、细胞的分布等。因而，用户能够基于复原切片图像适当地选定要从切片中提取的位置。

在该情况下，在属性信息附加工序中，对构成复原切片图像的各个像素附加位置的信息来作为属性信息，该位置的信息表示构成复原切片图像的像素与小片排列内的哪个位置的小片对应。因而，根据复原切片图像内的要提取的位置的像素的位置的信息，能够容易且准确地确定要提取的小片是分割切片图像内的哪个小片。而且，通过将分割切片图像内的小片排列的像与实际的小片排列进行比较，即使是多个微小的小片，也能够易于从其中确定期望的小片。

在上述第一方式中，也可以包含颜色校正工序，在该颜色校正工序中，对于在所述复原切片图像内的相邻的所述小片的像的边界处隔着该边界而相邻的像素的颜色，基于相应像素的附近的像素的颜色来进行校正。

在复原切片图像中，小片的像之间的边界由于在将基板和切片分割时沿着分割线产生的毛边等而易于变得明显。因而，通过将位于边界的位置处的像素的颜色校正为与该像素的周围的像素的颜色相同或类似的颜色，能够复原为小片的像之间的边界不明显的、更自然的分割前的切片的整体像。

在上述第一方式中，也可以，在所述属性信息附加工序中，对构成所述分割切片图像的全部像素进一步附加区域信息来作为所述属性信息，该区域信息表示像素是否为构成所述小片的像的像素，在所述复原工序中，基于所述区域信息去除不构成所述小片的像的像素，将剩下的构成所述小片的像的像素彼此接合为一个像，由此生成所述复原切片图像。

由此，能够通过简单的处理来生成复原图像。

本发明的第二方式是一种细胞分取方法，包括以下工序：上述任一项所记载的图像处理方法；显示工序，显示所述复原切片图像；指定工序，针对在该显示工序中显示的所述复原切片图像指定要从所述切片中提取的位置；以及提取工序，基于对与在该指定工序中指定出的位置对应的像素附加的所述位置的信息来从所述小片排列中提取小片。