[发明专利]检测阴道毛滴虫的方法

说明书

1.发明领域

提供用于检测阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)的组合物和方法。

2.背景

原生动物阴道毛滴虫造成毛滴虫病(trichomoniasis)，其是常见性传播感染，可以感染男性和女性。每年在美国有七百四十万例毛滴虫病。毛滴虫病感染可以是有症状的或无症状的。参见，例如，Ginocchio等人，J.Clin.Microbiol.2012，50：2601-2608。在女性中，毛滴虫病是一系列包含阴道排出物的病况中的一种。参见，例如，Centers for Disease Control andPrevention(CDC).CDC fact sheet：trichomoniasis.2010.www.cdc.gov/std/trichomonas/STDFact-Trichomoniasis.htm。女性中的症状可能包括生殖器瘙痒、烧灼、发红、或疼痛，异味，排尿不适，或稀的澄清、白色、黄色或绿色排出物。参见同上。在男性中，毛滴虫病可以引起非淋病双球菌的尿道炎(NGU)。男性中的症状可能包括阴茎内部瘙痒或烧灼，射精或排尿后烧灼，或阴茎排泄物。参见，例如，Workowski等人，Centers for Disease Control and Prevention.Sexually transmitted disease treatment guidelines，2010.MMWR 2010；59(RR-12)：1-110；Centers for Disease Control and Prevention.Biosafety in Microbiological and Biomedical laboratories.www.cdc.gov/biosafety/publications/。

需要改善的检测阴道毛滴虫(TV)的方法。尤其是，需要高度特异的、准确的和灵敏的基于尿或拭子的诊断测试。

3.概述

在一些实施方案中，提供检测来自受试者的样品中存在或不存在阴道毛滴虫(TV)的方法。在一些实施方案中，提供确定受试者是否具有阴道毛滴虫(TV)感染的方法。在一些实施方案中，所述方法包括检测受试者的样品中存在或不存在TV 40S核糖体蛋白(Tv40Srp)基因或RNA。

在一些实施方案中，所述受试者之前未对TV感染进行治疗。在一些实施方案中，所述受试者之前对TV感染进行治疗。在一些实施方案中，之前的治疗包括一个以上剂量的甲硝哒唑或替硝唑。在一些实施方案中，所述受试者不具有任何TV感染症状。在一些实施方案中，所述受试者具有一种以上TV感染症状。在一些实施方案中，所述受试者具有选自阴道炎、尿道炎和子宫颈炎的一种以上症状。在一些实施方案中，所述受试者是女性并且具有选自以下各项的一种以上症状：生殖器瘙痒、烧灼、发红、和/或疼痛；生殖器异味；排尿不适；和稀的澄清、白色、黄色或绿色排出物。在一些实施方案中，所述受试者怀孕。在一些实施方案中，所述受试者是男性并且具有选自以下各项的一种以上症状：阴茎内瘙痒和/或烧灼；射精和/或排尿后烧灼；和阴茎排泄物。

在一些实施方案中，所述方法包括检测内源性对照。在一些实施方案中，内源性对照是样品充分性对照。在一些实施方案中，内源性对照是单拷贝人基因。在一些实施方案中，内源性对照选自HMBS、GAPDH、β肌动蛋白和β珠蛋白。

在一些实施方案中，所述方法包括检测外源性对照。在一些实施方案中，外源性对照是样品处理对照。在一些实施方案中，外源性对照包含预期不存在于样品中的DNA序列。在一些实施方案中，外源性对照是细菌基因。

在一些实施方案中，所述方法包括PCR。在一些实施方案中，所述方法包括定量PCR。在一些实施方案中，PCR反应从起始变性步骤通过最终延伸步骤耗费小于2小时，小于1小时，或小于30分钟。

在一些实施方案中，TV 40S核糖体蛋白(Tv40Srp)基因包含SEQ IDNO：4的序列。在一些实施方案中，所述方法包括将来自样品的核酸与用于检测TV 40S核糖体蛋白(Tv40Srp)基因或RNA的第一引物对接触。在一些实施方案中，所述方法包括将来自样品的核酸与用于检测内源性对照的第二引物对接触。在一些实施方案中，所述方法包括将来自样品的核酸与用于检测外源性对照的第三引物对接触。