[发明专利]在肺癌中检测出的新型融合基因

权利要求书

1.一种作为癌的责任突变(驱动突变)的基因融合的检测方法， 其特征在于，包括：

检测来自患有癌的被检测者的分离得到的试样中的下述(a)～(e) 中的任一种融合多核苷酸或者由其编码的多肽的工序：

(a)EZR-ERBB4融合多核苷酸，编码包括EZR的卷曲螺旋结构 域的全部或者一部分和ERBB4的激酶结构域并且具有激酶活性的多肽 的多核苷酸；

(b)KIAA1468-RET融合多核苷酸，编码包括KIAA1468的卷曲 螺旋结构域的全部或者一部分和RET的激酶结构域并且具有激酶活性 的多肽的多核苷酸；

(c)TRIM24-BRAF融合多核苷酸，编码包括BRAF的激酶结构 域并且具有激酶活性的多肽的多核苷酸；

(d)CD74-NRG1融合多核苷酸，编码包括CD74的跨膜结构域 和NRG1的EGF结构域并且具有增强细胞内信号转导的活性的多肽的 多核苷酸；以及

(e)SLC3A2-NRG1融合多核苷酸，编码包括SLC3A2的跨膜结 构域和NRG1的EGF结构域并且具有增强细胞内信号转导的活性的多 肽的多核苷酸。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，融合多核苷酸为下述 (a)～(e)中的任一种：

(a)编码下述多肽的EZR-ERBB4融合多核苷酸：

(i)由序列编号2所示的氨基酸序列构成的多肽、

(ii)由序列编号2所示的氨基酸序列构成的多肽中缺失、取代或 者添加1个或多个氨基酸的氨基酸序列所构成的、并且具有激酶活性 的多肽、或者

(iii)由与序列编号2所示的氨基酸序列具有80％以上的序列同 一性的氨基酸序列构成的、并且具有激酶活性的多肽；

(b)编码下述多肽的KIAA1468-RET融合多核苷酸：

(i)由序列编号4所示的氨基酸序列构成的多肽、

(ii)由序列编号4所示的氨基酸序列构成的多肽中缺失、取代或 者添加1个或多个氨基酸的氨基酸序列所构成的、并且具有激酶活性 的多肽、或者

(iii)由与序列编号4所示的氨基酸序列具有80％以上的序列同 一性的氨基酸序列构成的、并且具有激酶活性的多肽；

(c)编码下述多肽的TRIM24-BRAF融合多核苷酸：

(i)由序列编号6所示的氨基酸序列构成的多肽、

(ii)由序列编号6所示的氨基酸序列构成的多肽中缺失、取代或 者添加1个或多个氨基酸的氨基酸序列所构成的、并且具有激酶活性 的多肽、或者

(iii)由与序列编号6所示的氨基酸序列具有80％以上的序列同 一性的氨基酸序列构成的、并且具有激酶活性的多肽；

(d)编码下述多肽的CD74-NRG1融合多核苷酸：

(i)由序列编号8或者10所示的氨基酸序列构成的多肽、

(ii)由序列编号8或者10所示的氨基酸序列构成的多肽中缺失、 取代或者添加1个或多个氨基酸的氨基酸序列构成的、具有增强细胞 内信号转导的活性的多肽、或者

(iii)由与序列编号8或者10所示的氨基酸序列具有80％以上的 序列同一性的氨基酸序列构成的、具有增强细胞内信号转导的活性的 多肽；和

(e)编码下述多肽的SLC3A2-NRG1融合多核苷酸：

(i)由序列编号36所示的氨基酸序列构成的多肽、

(ii)由序列编号36所示的氨基酸序列构成的多肽中缺失、取代 或者添加1个或多个氨基酸的氨基酸序列构成的、具有增强细胞内信 号转导的活性的多肽、或者

(iii)由与序列编号36所示的氨基酸序列具有80％以上的序列同 一性的氨基酸序列构成的、具有增强细胞内信号转导的活性的多肽。