[发明专利]用于样品处理的组合物和方法

权利要求书

1.一种对样品材料进行条形码化的方法，其包括：

(a)提供珠子，其包含与之关联的多个核酸条形码分子，所述多个核酸条形码分子包含共同条形码序列；

(b)将所述珠子与样品材料的组分共同分配至分区；

(c)将所述多个核酸条形码分子中的核酸条形码分子从所述珠子释放至所述分区内；以及

(d)将所述核酸条形码分子附接至所述分区内的样品材料的一种或多种组分或其片段。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少1,000个与之关联的核酸条形码分子，所述至少1,000个核酸条形码分子具有共同条形码序列。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少10,000个与之关联的核酸条形码分子，所述至少10,000个核酸条形码分子具有共同条形码序列。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少100,000个与之关联的核酸条形码分子，所述至少100,000个核酸条形码分子具有共同条形码序列。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述珠子包含至少1,000,000个与之关联的核酸条形码分子，所述至少1,000,000个核酸条形码分子具有共同条形码序列。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个核酸条形码分子可释放地偶联至该珠子。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述珠子包括凝胶珠子。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述分区包含小滴。

9.根据权利要求6所述的方法，其中所述(b)包括使包含珠子的第一水性流体与包含样品材料的组分的第二水性流体在不混溶流体内的小滴中组合。

10.根据权利要求1所述的方法，其中(c)包括降解所述珠子。

11.根据权利要求6所述的方法，其中(c)包括降解所述珠子，以将所述核酸条形码分子释放至所述分区内。

12.根据权利要求6所述的方法，其中(c)包括切割所述核酸条形码分子与所述珠子之间的化学联接。

13.根据权利要求6所述的方法，其中所述珠子的交联和所述珠子与所述多个核酸条形码分子之间的联接中的至少一种包括二硫键，并且其中(c)包括使所述珠子暴露于还原剂。

14.根据权利要求13所述的方法，其中所述还原剂是二硫苏糖醇(DTT)或三(2-羧基乙基)膦(TCEP)。

15.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品材料的组分包含一个或多个模板核酸分子，并且其中(d)包括将所述核酸条形码分子附接至所述一个或多个模板核酸分子的一个或多个片段。

16.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品材料的组分包含一个或多个模板核酸分子，所述多个核酸条形码分子还包含与所述一个或多个模板核酸分子的至少一部分互补的引物序列，并且(d)包括延伸所述核酸条形码分子以复制所述一个或多个模板核酸分子的至少一部分。

17.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品材料的组分包含单细胞的内含物。

18.根据权利要求17所述的方法，其中所述单细胞包括癌细胞。

19.根据权利要求17所述的方法，其中所述单细胞包括细菌细胞。