[发明专利]采用微流控装置的空间编码生物分析有效
| 申请号: | 201480046929.6 | 申请日: | 2014-06-25 |
| 公开(公告)号: | CN105473744B | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
| 发明(设计)人: | 马克·S·朱;大卫·罗腾伯格 | 申请(专利权)人: | 普罗格诺西斯生物科学公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6809 | 分类号: | C12Q1/6809 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
| 地址: | 美国加利福尼*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 采用 微流控 装置 空间 编码 生物 分析 | ||
1.确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
(a)将用于结合生物靶标的探针传递至样品,所述探针包括可结合所述生物靶标的结合部分,其中所述探针包括识别所述生物靶标或靶标结合部分的识别标签;
(b)将来自步骤(a)的样品加载至具有多条第一寻址通道的第一微流控装置,其中每条第一寻址通道识别所述样品中的第一区域;
(c)通过每条所述第一寻址通道将第一地址标签传递至所述样品中的每个第一区域,其中每个第一地址标签与所述探针耦合;
(d)将来自步骤(c)的样品加载至具有多条第二寻址通道的第二微流控装置,其中每条第二寻址通道识别所述样品中的第二区域,所述第二区域与被所述第一寻址通道识别的第一区域以大于0度的角度相交;
(e)通过每条所述第二寻址通道将第二地址标签传递至所述样品中的每个第二区域,其中每个第二地址标签与所述探针耦合,通过位于第一区域和第二区域之间的相交点的所述第一地址标签和所述第二地址标签确定所述相交点的位置;
(f)分析结合了所述生物靶标的所述探针,所述分析包括:(1)通过测定结合了所述生物靶标的所述探针的量来确定所述生物靶标的丰度、表达和/或活性;和(2)确定位于每个位置的所述识别标签以及所述第一和第二地址标签的身份;以及
(g)基于步骤(f)的分析确定所述样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布。
2.确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
(a)将样品加载至具有多条第一寻址通道的第一微流控装置,其中每条第一寻址通道识别所述样品中的第一区域;
(b)通过每条所述第一寻址通道将用于结合生物靶标的第一探针传递至所述样品中的每个第一区域,所述探针包括:(1)可结合所述生物靶标的第一结合部分;(2)识别所述样品中某一区域的第一地址标签,所述第一探针被传递至所述区域;以及(3)识别所述生物靶标或所述第一结合部分的第一识别标签;
(c)将来自步骤(b)的样品加载至具有多条第二寻址通道的第二微流控装置,其中每条第二寻址通道识别所述样品中的第二区域,所述第二区域与被所述第一寻址通道识别的第一区域以大于0度的角度相交;
(d)通过每条所述第二寻址通道将用于结合所述生物靶标的第二探针传递至所述样品中的每个第二区域,所述探针包括:(1)可结合所述生物靶标的第二结合部分;(2)识别所述样品中某一区域的第二地址标签,所述第一探针被传递至所述区域;和(3)识别所述生物靶标或所述第二结合部分的第二识别标签,通过位于第一区域和第二区域之间的相交点的所述第一地址标签和所述第二地址标签确定所述相交点的位置;
(e)分析结合了所述生物靶标的所述探针,所述分析包括:(1)通过测定结合了所述生物靶标的所述探针的量来确定所述生物靶标的丰度、表达和/或活性;和(2)确定每个位置上的所述第一和第二识别标签以及所述第一和第二地址标签的身份;以及
(f)基于步骤(e)的分析确定所述样品中的所述生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布。
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