[发明专利]多重获取载玻片成像中的引用

说明书

背景技术

本文公开的主题涉及在不同获取操作中获取的载玻片图像的多个集合的引用。

对于例如癌症、传染病、生理失调等等的各种生理条件来说，检测和监测可部分地基于来自患者的生物样本的分析。例如，可以分析样本以检测异常的细胞数量或细胞类型和/或可能有疾病或失调征兆的有机体的存在。针对这样的分析，可以使用各种类型的镜检。此外，各种染色剂和染色协议可用作这种分析的一部分以允许可帮助疾病或失调的检测或诊断的不同结构、化学药品或环境的显影。

为了便于这样的病理学或组织学样本的分析，已经开发了使图像获取过程的各个方面自动化的自动化镜检系统。具体地，数字光学显微镜可用在这样的自动化系统中并且为每次获取提供数字图像输出。某些这样的系统使用扫描显微镜，其中一连串移位的图像被获取并且被联系在一起（例如“并列显示（tiled）”或者“缝合”在一起）以形成所关心的样本区域的合成物。例如，在病理学或组织学成像操作的背景下，组织样本载玻片可经历成像以便以高放大率和/或分辨率获取小的邻近或重叠区域的数字图像。邻近的或重叠的图像然后可被连接或联系起来以形成可在数字显示装置上操纵的更大的图像。以这种方式，可由审阅者生成、显示和操纵样本的合成或镶嵌图像。

图像生成和审阅过程中的复杂因素可被认为是协议造成的，其中样本经历了多个染色操作。在这样的实例中，每个染色步骤与从显微镜镜台移开载玻片、处理样本以移除任何现存的染色剂并且施加下一染色剂以及将载玻片放回显微镜镜台上用于利用新染色剂对样本成像相关联。然而，移开载玻片并将载玻片放回显微镜镜台上的动作通常导致就每一轮（round）成像而言载玻片处在稍微不同的位置。结果，来自每一轮成像的对应图像可能未被对准。此外，为每一轮成像生成的合成图像也可能相对于彼此未被对准。结果，利用使用不同染色剂获取的图像所引导的分析或比较可能是困难的或相反是被禁止的。

发明内容

在一个实施例中，提供了用于配准图像的计算机实现的方法。根据这种方法，获取位于镜台上的载玻片上的样本的图像的第一集合。以不同的视场来获得每个图像。通过配准所述第一集合中的图像至彼此来生成全局变换矩阵以形成合成图像。在将载玻片从镜台移开并且将载玻片放回镜台上之后，获取载玻片上的样本的图像的子集合。所述图像的子集合少于所述第一集合中的图像的数量。所述子集合中的每个图像与所述图像的第一集合中的对应图像配准以确定平移、旋转和缩放因子。以用来获取所述图像的第一集合的相同的相应视场来获取样本的图像的第二集合。使用为所述图像的子集合确定的旋转和缩放因子来旋转和缩放所述图像的第二集合中的每个图像。所述第二集合中的经旋转和缩放的图像被配准至所述第一集合中的对应图像。

在又一个实施例中，提供了图像分析系统。所述图像分析系统包括存储一个或多个例程的存储器和配置成执行存储在存储器中的所述一个或多个例程的处理部件。在被处理部件执行时所述一个或多个例程会引起将要被执行的动作，所述动作包括：执行获取的样本的图像的有限集合和先前获取的样本的图像的完整集合之间的对准操作，其中对准操作生成使所述图像的有限集合和所述图像的完整集合中的对应图像联系起来的至少旋转；按照所述旋转来旋转后续获取的图像的完整集合；以及平移所述后续获取的图像的完整集合中的被旋转的图像以将所述被旋转的图像与所述先前获取的图像的完整集合中的对应图像配准。

在另外的实施例中，提供了数字镜检成像系统。所述数字镜检成像系统包括：配置成支撑载玻片的镜台；配置成获取当存在时载玻片的一部分的图像的物镜和图像传感器；配置成根据成像协议相对于彼此移动物镜和镜台中的一个或两者的位置控制器；以及配置成控制位置控制器和图像传感器中的一个或两者的操作的控制器。另外，数字镜检成像系统包括存储一个或多个例程的存储器和配置成执行存储在存储器中的所述一个或多个例程的处理部件。在被处理部件执行时所述一个或多个例程会引起将要被执行的动作，所述动作包括：获取至少载玻片的一部分的图像的第一完整集合，其中每个图像与至少一个邻近图像重叠；在将载玻片从镜台移开并且将载玻片放回镜台上之后获取至少所述载玻片的所述一部分的图像的第二完整集合；按照预定角度来旋转所述图像的第二完整集合中的图像以生成预旋转的图像的集合；以及平移预旋转的图像以将预旋转的图像配准至所述图像的第一完整集合中的对应图像。

附图说明

当参考附图阅读以下详尽的描述时，本发明的这些以及其它的特征、方面和优势将变得更好理解，其中整个附图中，相同的记号代表相同的部分，其中：