[发明专利]一种与猪眼肌面积性状有关的猪UNC13B基因SNP标志物

权利要求书

1.一种与猪眼肌面积性状有关的猪UNC13B基因SNP标志物，其特征在于，该标志物为UNC13B基因chr1:263861722位点的T/C突变，所述位点基于的Assembly编号为Sscrofa10.2。

2.一种用于检测权利要求1所述的SNP标志物的特异性引物，其特征在于，所述引物为：

STA： 5′-CACACTCATTGTATCAATCATAGAGGAA-3′，

LSP： 5′- AACCACCAAAGAGAGAGAGCCA -3′，

ASP1：5′- AGAATTCCTACACGCTTGTTCTGAAT -，3′

ASP2：5′- GAATTCCTACACGCTTGTTCTGAAC -3′，

其中，STA为预扩增上游引物，LSP为用于预扩增和鉴定PCR的下游引物，ASP1为用于鉴定PCR的分型引物1，ASP2为用于鉴定PCR的分型引物2；

STA和LSP用于通过预扩增PCR扩增UNC13B基因chr1:263861722位点上下游的序列获得99bp预扩增产物，ASP1和ASP2用于鉴定待测猪个体的UNC13B基因chr1:263861722位点的基因型。

3.一种检测权利要求1所述的SNP标志物的方法，其特征在于，包括利用权利要求2中所述的引物进行以下步骤：

预扩增PCR：以待测猪基因组DNA为模板，STA和LSP为引物通过PCR反应获得UNC13B基因chr1:263861722位点上下游共99bp的预扩增产物；

鉴定PCR：以预扩增产物为模板，LSP为下游引物，ASP1/ASP2为上游引物，获得鉴定PCR扩增产物，判定所述SNP标志物的基因型。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，预扩增PCR的反应体系为：

2×Multiplex PCR Master Mix : 2.5 μl

10×STA primer pool : 0.5 μl

ddH₂O： 0.75 μl

DNA 模板: 1.25 μl；

预扩增PCR的反应程序为：

95℃预变性15min；95℃变性15s，60℃退火4min，14个循环；72℃延伸5-8min。

5.根据权利要求3或4所述的方法，其特征在于，鉴定PCR的反应以预扩增产物为模板，LSP为下游引物，ASP1/ASP2为上游引物，按照所使用的基因分型芯片所给出的程序进行SNP位点基因型鉴定。

6.一种检测猪眼肌面积性状的试剂盒，其特征在于，含有权利要求2所述的特异性引物。

7.权利要求1所述的SNP标志物或权利要求2所述的引物在猪育种中的应用。