[发明专利]与猪背膘厚性状相关的分子标记

说明书

技术领域

本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及与猪背膘厚性状相关的分子标记及应用。

背景技术

我国是生猪养殖大国，也是猪肉消费大国。随着养殖业的发展，培育优质的瘦肉型猪，成为了研究的热点。由于瘦肉率与背膘厚高度相关，且瘦肉率测定较为复杂，所以通过选择背膘厚而间接选择瘦肉率，是育种研究的主要手段。

传统的背膘厚性状选择主要是在猪达100kg时，通过B型超声波测定仪扫描测定倒数第3-4肋骨间左侧距背中线5cm处的背膘厚，然后将背膘较薄的个体留作种用。这种检测方法减缓了育种进程，且易受饲养环境影响，导致留种准确度下降。随着分子生物学的发展，分子标记辅助选择(marker-assisted selection，MAS)在猪育种中发挥越来越重要的作用，大大加快了育种进程。(鲁绍雄等,动物育种方法的回顾与展望[J].国外畜牧科技,2000,27(1):24-28.)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是育种中运用较多的分子标记方法，主要思路是通过候选基因法确定研究基因，在确定基因的SNP位点后通过测序或酶切等方法进行SNP分型(Beuzen N D等,Molecular markers and their use in animal breeding[J].The Veterinary Journal,2000,160(1):42-52.)，获得不同个体在DNA水平的差异，然后通过关联分析，从而得到具有指导育种实践的基因型个体。

β-羟脂酰CoA脱氢酶基因(Hydroxyacyl-CoA Dehydrogenase简称HADH基因)编码的β-羟脂酰CoA脱氢酶，可以催化β-羟脂酰CoA脱去两个氢原子生成β-羟脂酰CoA，是脂肪酸在生物体内被利用过程中，脂肪酸β-氧化的重要限速酶。HADH基因在脂肪酸代谢过程中至关重要，然而是否影响脂肪沉积，目前未见报道。所以本发明选择HADH为候选基因，通过对群体样品的扩增，利用测序仪对DNA片段进行测序，从测序峰图上直接读取单核苷酸多态性SNP位点的基因型，从而筛选出与背膘厚性状相关的分子标记。

本发明中，对HADH基因的内含子区域进行扩增，发现五个新的SNP位点，进一步完善了猪的SNP信息库，并对猪背膘厚性状的提高具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供与猪背膘厚性状相关的单核苷酸多态性(SNP)分子标记。本发明另一个目的在于提供与猪背膘厚性状相关的单核苷酸多态性分子标记的应用。

本发明通过以下技术方案实现：

申请人从报道的猪HADH基因中克隆得到与猪背膘厚性状相关的SNP分子标记，该分子标记的核苷酸序列如下所示：