[发明专利]一种FRAX综合症相关基因FMR1检测试剂盒及其应用有效
| 申请号: | 201410745451.8 | 申请日: | 2014-12-09 |
| 公开(公告)号: | CN104450911A | 公开(公告)日: | 2015-03-25 |
| 发明(设计)人: | 赵书民;赵翊均;陈金中;周巍 | 申请(专利权)人: | 上海五色石医学研究有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 31200 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
| 地址: | 201203 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 frax 综合症 相关 基因 fmr1 检测 试剂盒 及其 应用 | ||
1. 一种FRAX综合症相关基因FMR1突变的检测试剂盒,其特征在于,包含有FRAX相关基因FMR1突变检测探针组合物:包括第一对引物容器、第二引物容器、第三对引物容器和第四引物容器;所述第一引物容器内具有第一PCR引物对SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2的干燥粉末或溶液;所述第二引物容器内具有第二PCR引物对SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:3的干燥粉末或溶液;所述第三引物容器内具有第三PCR引物组SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:6的干燥粉末或溶液,所述第四引物容器内具有第四组PCR引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6的干燥粉末或溶液。
2. 如权利要求1所述检测试剂盒在FRAX综合症相关基因FMR1突变检测中的应用,其特征在于具体步骤为;
(1)提取检测对象的基因组DNA;
(2)采用平行对照方法,取等量基因组DNA建立HpalI酶切和对照体系,即两管反应体系,HpalI酶可以切开非甲基化DNA;
(3)以经上述预处理的DNA为模板,分别建立4个PCR反应体系;把4个PCR体系扩增产物等量混合,然后进行毛细管电泳,收集数据后用GENEMAPPER软件包分析;其中,蓝色和黑色产物代表未处理DNA,反映FMR1对应区域长度或(CGG)n拷贝数;绿色和红色产物代表甲基化可抵抗HpaII的DNA;通过比较蓝色和绿色产物峰得出甲基化情况;对于绿色和红色产物,因为一侧引物处于(CGG)n区,在FMR1相应区域长度大于仪器设定量程时提供最小长度判断。
3. 根据权利要求2所述的应用,其特征在于步骤(2)中所述采用平行对照方法,取等量基因组DNA建立HpaII酶切和对照体系即两管反应体系,其中A管仅使用HpaII酶缓冲液对照,B管使用HpaII酶切;A管DNA可以被4个引物组扩增,B管非甲基化DNA对应位点被切开,不能被扩增,而甲基化DNA保持完整可以被引物扩增;具体为:A管加入DNA模板100 ng,Hpa1I(NEB)缓冲液 1μL,Hpa II 0.2 μL,加水到10 μL, 37℃ 2Hr;80℃,20 min;B管加入DNA模板100 ng,HpaII(NEB)缓冲液 1μL,加水到10μL, 37℃ 2Hr;80℃,20 min。
4. 根据权利要求2所述的应用,其特征在于步骤(3)中所述分别建立4个PCR反应体系,具体为:
第1管反应体系:
A管处理模板 1 μL
KOD-FX酶 1单位
2× KOD-FX 缓冲液 5 μL
2.5 mM dNTPs 1 μL
第一对引物混合物 1 μL
加水到10 μL;
第2管反应体系:
B管处理模板 1 μL
KOD-FX酶 1单位
2× KOD-FX 缓冲液 5 μL
2.5 mM dNTPs 1 μL
第二对引物混合物 1 μL
加水到10 μL;
第3管反应体系:
A管处理模板 1 μL
KOD-FX酶 1单位
2× KOD-FX 缓冲液 5 μL
2.5 mM dNTPs 1 μL
第三组引物混合物 1 μL
加水到10 μL;
第4管反应体系:
B管处理模板 1 μL
KOD-FX酶 1单位
2× KOD-FX 缓冲液 5 μL
2.5 mM dNTPs 1 μL
第四组引物混合物 1 μL
加水到10 μL;
反应条件:KOD-FX,98℃ 2分钟;98℃ 20秒、68℃ 4分钟共40个循环;68℃保温60分钟。
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