[发明专利]一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因及其剪切突变体的方法在审
申请号: | 201410725610.8 | 申请日: | 2014-12-05 |
公开(公告)号: | CN104630343A | 公开(公告)日: | 2015-05-20 |
发明(设计)人: | 高广勋 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第四军医大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 无 | 代理人: | 无 |
地址: | 710032 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 慢性 粒细胞 白血病 bcr abl 融合 基因 及其 剪切 突变体 方法 | ||
技术领域
本发明涉及血液病分子生物学领域,尤其涉及一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因及其剪接突变体的方法。
背景技术
慢性粒细胞白血病是造血组织的恶性肿瘤,BCR/ABL融合基因及其不同突变体的检测是该病诊断、病情监测、预后及指导治疗的一个关键指标。目前的检测方式很难同时检测该基因的不同突变体,大多只能检测其中一个基因,且检出率低,耗费时间较长。
因此,现有技术有待于改进。
发明内容
本发明为了解决现有技术的不足,提供一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用多重巢式PCR方法,短时间内快速检测出BCR/ABL融合基因及其不同突变体。
为解决上述技术问题,本发明实施例提供的一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用如下技术方案:
一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)A液:特异性逆转录引物
引物ABL(RT)及E2A(RT)等比例用DEPC水稀释混匀,浓度为2.5pmol/μl;
B液:巢式第一轮PCR反应液500μl(20测试):
包含引物为:BCR-1、BCR-3、ABL-1、E2A-1、E2A-3;
第一轮多重PCR引物100pmol/条,缓冲体系为:Tris-HCL(PH8.3)8.8MM、KCL 44MM、dNTPs 0.16MM/each、MgCL21.32MM。储存于-20℃,备用;
C液:巢式第二轮PCR反应液500μl(20测试):
包含引物为:BCR-2、BCR-4、ABL-2、E2A-2、E2A-4;
各组第二轮多重PCR引物125pmol/条,反应缓冲体系为:Tris-HCL(PH 8.3)9.6MM、KCL 48MM、dNTPs 0.192MM/each、MgCL21.44MM,储存于-20℃,
D液:阴性对照(阳性内对照)健康人外周血单个核细胞cDNA溶液,
E液:阳性对照-BCR/ABL b3a2阳性K562细胞系cDNA溶液,
F液:阳性对照-BCR/ABL e1a2阳性患者cDNA溶液,
G液:阳性对照-BCR/ABL b2a2阳性患者cDNA溶液;
(2)采用广泛表达的转录因子增强子结合因子基因(E2A)的mRNA作为阳性内对照;
(3)巢式第一轮PCR(25μl体系):各取患者cDNA、阴性对照D液和阳性对照E液2μl,各取B液22ul,Taq DNA聚合酶0.5μl(1.25U),PCR条件为:95℃5min后,95℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸10min,共30个循环,结束反应;
(4)巢式第二轮PCR(25ul体系):各取C液22μl,相应的第1轮PCR产物2μl,Taq DNA聚合酶0.5μl(1.25U)。PCR反应条件同第一轮。
本发明提供的一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,采用特异性的反转录引物,提高转录效率,采用多重巢式PCR方式增加PCR效果,较短时间内快速检测出BCR/ABL融合基因及其不同突变体,为疾病的早期诊断及靶向治疗提供依据。
附图说明
图1为BCR/ABL融合基因PCR产物琼脂糖凝胶电泳EB染色后紫外灯下成像结果。
具体实施方式
下面结合本发明实施例提供的快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法进行详细描述。
如图1所示,本发明实施例提供的一种快速检测慢性粒细胞白血病BCR/ABL融合基因的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)A液:特异性逆转录引物
引物ABL(RT)及E2A(RT)等比例用DEPC水稀释混匀,浓度为2.5pmol/μl,
B液:巢式第一轮PCR反应液500μl(20测试):
包含引物为:BCR-1,BCR-3,ABL-1,E2A-1,E2A-3,
第一轮多重PCR引物100pmol/条,缓冲体系为:Tris-HCL(ph 8.3)8.8MM、KCL 44MM、dNTPs 0.16MM/each、MgCL21.32MM。储存于-20℃,备用,
C液:巢式第二轮PCR反应液500μl(20测试):
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