[发明专利]一种应用145个SNP鉴定五指山小型猪近交系的方法有效

专利信息
申请号: 201410562272.0 申请日: 2014-10-21
公开(公告)号: CN104293963A 公开(公告)日: 2015-01-21
发明(设计)人: 冯书堂;牟玉莲;韩建林;李奎;高倩 申请(专利权)人: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅;何叶喧
地址: 100193 北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 应用 145 snp 鉴定 五指山 小型 近交系 方法
【权利要求书】:

1.一种辅助鉴定待测猪是否为五指山小型猪近交系的方法,包括如下步骤:

检测待测猪基于145个SNP位点的基因型;

如果满足如下(1)至(145)的所有标准,待测猪为候选的五指山小型猪近交系:

(1)M1GA0025062  SNP位点的基因型为GG;

(2)DRGA0017627  SNP位点的基因型为GG;

(3)H3GA0056137  SNP位点的基因型为CC;

(4)MARC0039661  SNP位点的基因型为AA;

(5)ASGA0085025  SNP位点的基因型为TT;

(6)ASGA0098570  SNP位点的基因型为GG;

(7)MARC0063358  SNP位点的基因型为AA;

(8)ASGA0085437  SNP位点的基因型为GG;

(9)MARC0096709  SNP位点的基因型为CC;

(10)H3GA0052387 SNP位点的基因型为GG;

(11)ASGA0000264 SNP位点的基因型为TT;

(12)ALGA0000195 SNP位点的基因型为TT;

(13)H3GA0001444 SNP位点的基因型为AA;

(14)ASGA0002293 SNP位点的基因型为CC;

(15)INRA0001752 SNP位点的基因型为GG;

(16)H3GA0001445 SNP位点的基因型为GG;

(17)ALGA0002595 SNP位点的基因型为TT;

(18)ALGA0002600 SNP位点的基因型为GG;

(19)DRGA0000563 SNP位点的基因型为CC;

(20)DRGA0000565 SNP位点的基因型为CC;

(21)INRA0001761 SNP位点的基因型为AA;

(22)MARC0104045 SNP位点的基因型为CC;

(23)ALGA0002601 SNP位点的基因型为CC;

(24)DRGA0000569 SNP位点的基因型为AA;

(25)ALGA0002608 SNP位点的基因型为TT;

(26)DRGA0000568 SNP位点的基因型为CC;

(27)ALGA0002604 SNP位点的基因型为GG;

(28)MARC0048118 SNP位点的基因型为TT;

(29)ASGA0004229 SNP位点的基因型为CC;

(30)MARC0007088 SNP位点的基因型为CC;

(31)MARC0000061 SNP位点的基因型为GG;

(32)MARC0094747 SNP位点的基因型为AA;

(33)MARC0007969 SNP位点的基因型为AA;

(34)ASGA0106092 SNP位点的基因型为CC;

(35)ALGA0119806 SNP位点的基因型为GG;

(36)INRA0003745 SNP位点的基因型为AA;

(37)INRA0003746 SNP位点的基因型为TT;

(38)ALGA0005490 SNP位点的基因型为CC;

(39)H3GA0002538 SNP位点的基因型为CC;

(40)INRA0003749 SNP位点的基因型为CC;

(41)H3GA0002539 SNP位点的基因型为GG;

(42)M1GA0001099 SNP位点的基因型为CC;

(43)MARC0111831 SNP位点的基因型为AA;

(44)ASGA0005566 SNP位点的基因型为CC;

(45)ALGA0007578 SNP位点的基因型为CC;

(46)ASGA0005568 SNP位点的基因型为CC;

(47)INRA0005765 SNP位点的基因型为AA;

(48)MARC0095347 SNP位点的基因型为CC;

(49)MARC0039015 SNP位点的基因型为CC;

(50)DRGA0001892 SNP位点的基因型为GG;

(51)ALGA0007580 SNP位点的基因型为GG;

(52)ALGA0007583 SNP位点的基因型为TT;

(53)MARC0095915 SNP位点的基因型为CC;

(54)ASGA0005571 SNP位点的基因型为AA;

(55)MARC0014134 SNP位点的基因型为AA;

(56)MARC0024233 SNP位点的基因型为AA;

(57)H3GA0003548 SNP位点的基因型为GG;

(58)ALGA0007591 SNP位点的基因型为CC;

(59)MARC0000195 SNP位点的基因型为CC;

(60)ALGA0038697 SNP位点的基因型为CC;

(61)H3GA0020000 SNP位点的基因型为CC;

(62)ALGA0038703 SNP位点的基因型为CC;

(63)H3GA0020002 SNP位点的基因型为GG;

(64)DRGA0007138 SNP位点的基因型为CC;

(65)ASGA0031284 SNP位点的基因型为CC;

(66)ASGA0031285 SNP位点的基因型为AA;

(67)MARC0025042 SNP位点的基因型为GG;

(68)H3GA0020006 SNP位点的基因型为TT;

(69)ALGA0038729 SNP位点的基因型为CC;

(70)ALGA0038731 SNP位点的基因型为GG;

(71)ASGA0031321 SNP位点的基因型为GG;

(72)ASGA0031322 SNP位点的基因型为GG;

(73)ALGA0038747 SNP位点的基因型为AA;

(74)ASGA0033095 SNP位点的基因型为TT;

(75)ALGA0040854 SNP位点的基因型为GG;

(76)ALGA0040856 SNP位点的基因型为AA;

(77)ALGA0040857 SNP位点的基因型为GG;

(78)ASGA0033096 SNP位点的基因型为GG;

(79)INRA0025180 SNP位点的基因型为AA;

(80)ALGA0040859 SNP位点的基因型为CC;

(81)H3GA0021216 SNP位点的基因型为CC;

(82)ASGA0033098 SNP位点的基因型为CC;

(83)H3GA0021221 SNP位点的基因型为CC;

(84)MARC0014540 SNP位点的基因型为CC;

(85)ASGA0033103 SNP位点的基因型为CC;

(86)DIAS0000557 SNP位点的基因型为AA;

(87)ASGA0033116 SNP位点的基因型为AA;

(88)ASGA0036835 SNP位点的基因型为CC;

(89)MARC0031932 SNP位点的基因型为CC;

(90)ASGA0036838 SNP位点的基因型为CC;

(91)H3GA0023523 SNP位点的基因型为GG;

(92)ALGA0045460 SNP位点的基因型为TT;

(93)MARC0005927 SNP位点的基因型为GG;

(94)MARC0005928 SNP位点的基因型为AA;

(95)ASGA0036842 SNP位点的基因型为CC;

(96)ASGA0036846 SNP位点的基因型为CC;

(97)MARC0098637 SNP位点的基因型为TT;

(98)M1GA0011035  SNP位点的基因型为TT;

(99)DRGA0008230  SNP位点的基因型为GG;

(100)ASGA0036855 SNP位点的基因型为CC;

(101)ALGA0097277 SNP位点的基因型为GG;

(102)MARC0080197 SNP位点的基因型为CC;

(103)H3GA0050489 SNP位点的基因型为TT;

(104)ALGA0097281 SNP位点的基因型为TT;

(105)H3GA0050490 SNP位点的基因型为CC;

(106)ALGA0097282 SNP位点的基因型为TT;

(107)ASGA0079089 SNP位点的基因型为CC;

(108)INRA0055354 SNP位点的基因型为GG;

(109)ASGA0079091 SNP位点的基因型为TT;

(110)ASGA0079090 SNP位点的基因型为CC;

(111)H3GA0050491 SNP位点的基因型为AA;

(112)MARC0056017 SNP位点的基因型为TT;

(113)MARC0055759 SNP位点的基因型为AA;

(114)H3GA0050495 SNP位点的基因型为GG;

(115)ALGA0097291 SNP位点的基因型为GG;

(116)ALGA0097290 SNP位点的基因型为GG;

(117)CASI0006683 SNP位点的基因型为GG;

(118)ASGA0079098 SNP位点的基因型为CC;

(119)ALGA0097297 SNP位点的基因型为GG;

(120)H3GA0054426 SNP位点的基因型为TT;

(121)ALGA0098112 SNP位点的基因型为GG;

(122)MARC0089391 SNP位点的基因型为GG;

(123)ASGA0089892 SNP位点的基因型为AA;

(124)ASGA0097792 SNP位点的基因型为CC;

(125)MARC0046857 SNP位点的基因型为GG;

(126)MARC0077194 SNP位点的基因型为AA;

(127)ALGA0108769 SNP位点的基因型为CC;

(128)H3GA0050799 SNP位点的基因型为CC;

(129)ALGA0098120 SNP位点的基因型为CC;

(130)ALGA0098123 SNP位点的基因型为GG;

(131)ALGA0098128 SNP位点的基因型为GG;

(132)ASGA0079719 SNP位点的基因型为CC;

(133)ASGA0079728 SNP位点的基因型为GG;

(134)ASGA0080429 SNP位点的基因型为CC;

(135)MARC0052755 SNP位点的基因型为GG;

(136)ALGA0098918 SNP位点的基因型为GG;

(137)ASGA0080432 SNP位点的基因型为GG;

(138)ALGA0098922 SNP位点的基因型为CC;

(139)INRA0056206 SNP位点的基因型为GG;

(140)INRA0056207 SNP位点的基因型为CC;

(141)ASGA0080435 SNP位点的基因型为CC;

(142)MARC0068495 SNP位点的基因型为GG;

(143)ASGA0080436 SNP位点的基因型为CC;

(144)MARC0003370 SNP位点的基因型为CC;

(145)ASGA0085659 SNP位点的基因型为CC;

如果不满足上述(1)至(145)的所有标准,待测猪为候选的非五指山小型猪近交系。

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