[发明专利]微阵列底物上的生物材料的选择性处理

说明书

在先申请

    本申请是国际申请日为2009年9月18日的国际PCT/US2009/057539进入中国、申请号为200980145609.5的题为“微阵列底物上的生物材料的选择性处理”的发明专利申请的分案申请。本申请要求2008年9月22日提交的美国临时申请系列号61/099,035和2008年10月16日提交的美国临时专利申请系列号61/106,083的权益，二者通过引用方式并入本文。

技术领域

本发明涉及在微阵列载玻片表面上的生物材料的处理。因此，本发明涉及分子生物学和化学领域。

背景技术

微阵列是一种高通量技术，其由被称作“特征”的排列的一系列数以千计的生物材料的精微的斑点组成。例如，DNA微阵列包括含有特定DNA序列的DNA片段的特征。这可以包括基因或其它DNA元件的短的部分，其被用作可以在适当的条件下与cDNA或cRNA样品（有时称作靶标）杂交的探针。使用基于荧光的检测法通过检测荧光团标记的靶标来测定核酸序列的相对丰度，从而可以检测并定量探针-靶标的杂交。在标准的微阵列中，探针与固体表面例如玻璃或硅共价偶联。

发明内容

本发明提供了用于从微阵列载玻片上的一个或多个独特的和/或不连续的空间位置上选择性洗脱生物材料的方法和系统。例如，在一个方面，用于回收与微阵列载玻片偶联的生物材料的方法可以包括：选择要从微阵列载玻片回收的生物材料，在微阵列载玻片表面上的独特或不连续空间区域内找到该生物材料，并且从所述独特的空间区域洗脱至少一部分所选择的生物材料，但不从所述独特或不连续空间区域之外的微阵列载玻片区域洗脱实质数量的非选择的生物材料。在一个具体方面，洗脱进一步包括向所述独特或不连续空间区域施加洗脱缓冲液。在另一个具体方面，所述洗脱缓冲液是变性缓冲液，其作用是从微阵列载玻片表面释放该部分的生物材料。在另一个具体方面，将至少一部分的不连续空间区域加热以促进从微阵列表面释放至少一部分所选择的生物材料。预期多种类型的生物材料用于本发明，包括但不限于，DNA、cDNA、RNA、肽、及其组合。

在本发明的另一个方面，提供了用于从微阵列回收核酸材料的方法。此方法可以包括：选择已经在独特或不连续空间区域内的微阵列载玻片表面上杂交的核酸材料，向所述独特空间区域施加变性缓冲液以使所选择的核酸材料至少部分变性，以及使用惰性回收缓冲液冲洗所述微阵列表面以回收所选择的核酸材料的变性的部分。在更具体的方面，该方法还可以包括从所述惰性回收缓冲液中收集所选择的核酸材料的变性的部分。在另一个更具体的方面，该方法还可以包括向所述独特空间区域施加热量以促进至少一部分所选择的核酸材料的变性。

本发明另外提供了用于从微阵列载玻片上的独特空间位置选择性洗脱生物材料的系统。例如，在一个方面，用于从微阵列回收核酸材料的系统可以包括：微阵列扫描器，其配置为扫描微阵列表面并鉴定待回收的核酸材料的位置；分配器，其配置为接收来自所述微阵列扫描器的输入并将洗脱缓冲液在由所述微阵列扫描器指定的位置处分配在所述微阵列表面的不连续分配区；和回收器，其配置为从所述微阵列表面回收所述洗脱缓冲液。还有可能接受来自另一个来源例如不同阵列的信息输入，以确定从哪个区域进行洗脱。在更具体的方面，所述系统还可以包括加热器，其配置为加热所述不连续分配区。在另一个更具体的方面，所述加热器是激光。