[发明专利]一种无创人肝癌早期检测与鉴别诊断方法及系统

权利要求书

1.一种无创人肝癌早期检测与鉴别诊断方法，包括下述步骤：1)从离体血浆中提取血浆游离DNA，构建基因组测序文库；2)对其进行测序，测定基因组DNA顺序并进行序列比对；3)以不同的基因组顺序长度为基本分析单元，进行染色体拷贝数变异CNV分析并构建染色体CNV图观察是否有目视可观察到的拷贝数改变；4)以不同的基因组顺序长度为基本分析单元，进行染色体拷贝数变异Z分值CNV的分析。

2.根据权利要求1的方法，其特征在于基本分析单元为0.05-5.0M的基因组顺序长度。

3.根据权利要求1的方法，其特征在于测序方法为高通量基因组测序或PCR测序。

4.根据权利要求1的方法，其特征在于所述步骤3)的操作为使用基因组测序数据测得的小片段数，按GC含量做标准化处理，计算每个染色体上每个基本分析单元测得的相对片段数，再与正常人对照组比较，计算CNV比值；将各染色体各基本分析单元的CNV比值与染色体位置作CNV图。

5.根据权利要求1的方法，其特征在于步骤4)是将样品每个基本分析单元与正常人对照组相比，以两组的均数差与对照组标准差之间的比例关系，计算样品基本分析单元测得顺序片段数的偏离正常群体的程度从而进行Z分值CNV分析。

6.根据权利要求5的方法，其特征在于Z分值CNV的判断标准为：一条染色体的长臂或短臂有两个或两个以上的基本分析单元Z分值或都大于4.0或都小于负4.0，或一个基本分析单元Z分值大于4.0或小于负4.0同时有其它4个基本分析单元Z分值或都大于3.0或都小于负3.0(同向)。上述界定值4.0也可以是3.0到6.0之间的其它数值。符合这个标准的Z分值CNV改变出现在人染色体1q或7q或19q，表现为拷贝数增加，或同时出现在人染色体1p，9q，14q，表现为拷贝数减少。

7.一种无创人肝癌早期检测与鉴别诊断系统，其特征在于包括试剂盒、DNA测序仪和计算机，所述试剂盒用来对提取的血浆游离DNA构建基因组测序文库，所述DNA测序仪进行基因组DNA测序；所述计算机基于测序数据进行CNV分析并构建染色体CNV图和进行Z分值CNV分析并输出分析结果。