[发明专利]黄瓜抗番木瓜环斑病毒病基因prsv的Indel标记及其应用

权利要求书

1.一种与黄瓜中抗番木瓜环斑病毒基因prsv连锁的Indel标记，其特征在于：所述标记的引物的核苷酸序列如下：

prsvInde2-F/prsvInde2-R：

CTTCCCCATCATCATACATC/AAGCAGGAGAATGAAACAAC；

所述引物扩增的与黄瓜中感番木瓜环斑病毒基因PRSV连锁的特征条带为176bp，其核苷酸序列如Seq ID No.1所示；

所述引物扩增的与黄瓜中抗番木瓜环斑病毒基因prsv连锁的特征条带为170bp，其核苷酸序列如Seq ID No.2所示。

2.权利要求1所述Indel标记在筛选具有抗番木瓜环斑病毒基因prsv的黄瓜种质资源中的应用，其步骤如下：

(1)采用上述Indel标记的引物对待选黄瓜材料的基因组DNA分别进行PCR扩增；

(2)对扩增结果进行凝胶电泳检测；

(3)从检测结果中筛选出现与抗番木瓜环斑病毒基因prsv连锁的Indel标记特征条带一致的材料。

3.根据权利要求2所述的应用，所述PCR扩增的反应体系为:1.5ng/ul DNA模板，所述引物正向和反向各5ng/ul，0.5μL/ul GoGreen Master Mix，其余为双蒸水。

4.根据权利要求2所述的应用，所述PCR扩增的程序为：94℃预变性4分钟；94℃变性15秒，55℃退火15秒，72℃延伸30秒，35个循环；72℃保温5分钟，16℃保存。

5.根据权利要求2-4任一所述的应用：所述凝胶电泳检测指，采用6％的非变性聚丙烯酰胺凝胶，于150V恒功率电泳分离，最后银染显色。