[发明专利]自动生成基因检测报告的方法及装置

说明书

本发明公开了一种自动生成基因检测报告的方法及装置，该方法包括：获取受检对象的遗传信息和样本信息；通过遗传信息查询基因数据库，获取与遗传信息对应的表征信息；调用基因检测报告的标准化模板，并将样本信息和与遗传信息对应的表征信息导入标准化模板中，自动生成基因检测报告。通过上述方式，本发明能够节约大量时间，保证准确性，及时使基因检测报告得到更新。

技术领域

本发明涉及一种自动生成基因检测报告的方法及装置。

背景技术

基因检测是从染色体结构、DNA序列、DNA变异位点或基因表达程度，提供给受检者与医疗研究人员评估一些与基因遗传有关的疾病、体质或个人特质的依据。

基因检测报告是以可供受检者与临床研究人员看得懂的方式来展现基因检测结果，它不仅包括基因检测的直接结果，还包括了对结果的解读。其中，对结果的解读可以提供对患病风险的预测和预防建议，可供受检者和临床医生参考，具有很重要的实用价值。目前，许多基因检测机构出具的基因检测报告几乎都是依靠手工录入的方式。

但是，手工摘录需要耗费大量的时间，准确性不能得到保证。另外，如果有新的研究发现，不能及时地更新报告。

发明内容

本发明主要解决的技术问题是提供一种自动生成基因检测报告的方法及装置，能够节约大量时间，保证准确性，及时使基因检测报告得到更新。

为解决上述技术问题，本发明采用的一个技术方案是：提供一种自动生成基因检测报告的方法，包括：获取受检对象的遗传信息和样本信息；通过所述遗传信息查询基因数据库，获取与所述遗传信息对应的表征信息，所述基因数据库中保存有所述遗传信息与表征信息之间的对应关系；调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告。

其中，所述调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告的步骤之前，包括：确定所述基因检测报告的标准化模板的格式；采用拉泰赫LaTeX源代码编写所述基因检测报告的标准化模板。

其中，所述遗传信息是基因分型结果，所述表征信息是疾病信息，所述基因数据库是疾病基因数据库。

其中，所述调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告的步骤，包括：调用所述基因检测报告的标准化模板；将所述样本信息和与所述基因分型结果对应的疾病信息导入所述标准化模板中；设置与疾病相关的筛选条件；根据所述与疾病相关的筛选条件，运行所述生成基因检测报告的纯文本文件，获得基因检测报告的纯文本文件；将所述基因检测报告的纯文本文件生成便携式文件格式PDF的基因检测报告。

其中，所述通过所述遗传信息查询基因数据库，获取与所述遗传信息对应的表征信息的步骤之前，包括：从文献资料或数据库中提取所需的与所述遗传信息相关的数据信息；确定所述数据信息的数据格式；根据所述数据信息和所述数据格式建立所述基因数据库。

为解决上述技术问题，本发明采用的另一个技术方案是：提供一种自动生成基因检测报告的装置，所述装置包括：第一获取模块，用于获取受检对象的遗传信息和样本信息；第二获取模块，用于通过所述遗传信息查询基因数据库，获取与所述遗传信息对应的表征信息，所述基因数据库中保存有所述遗传信息与表征信息之间的对应关系；报告生成模块，用于调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告。

其中，所述装置还包括：第一确定模块，用于确定所述基因检测报告的标准化模板的格式；编写模块，用于采用拉泰赫LaTeX源代码编写所述基因检测报告的标准化模板。

其中，所述遗传信息是基因分型结果，所述表征信息是疾病信息，所述基因数据库是疾病基因数据库。