[发明专利]与猪肉质及产肉量相关的分子标记及其组合应用

说明书

技术领域

本发明涉及一组分子标记及其组合应用；特别涉及一种与猪肉质及产肉量相关的分子标记及其组合应用。 

背景技术

猪肉是动物蛋白的主要来源，而我国是传统的猪肉消费大国，猪肉作为中国人的传统肉食品，与人民生活品质的提高息息相关。我国是世界上养猪最早的国家之一，养猪的历史达几千年之久，经过祖先辛勤的饲养和选育，形成了各具特色的地方品种。中国地方品种具有许多突出的优点，比如肉质好，产仔数高、抗逆性好和适应性强等，但有两个共同的缺点：瘦肉率低和增重慢。国外培育的瘦肉型品种和品系，虽然饲料转化率高、生长快、瘦肉产量多，但肉质不好，白肌肉(PSE肉)出现的机率高。随着我国社会经济的发展，人民生活水平与消费水平的提高，带来了人们膳食结构与饮食观念的变化，在满足猪肉消费数量上的要求外，消费者对猪肉品质的要求也越来越高。因此，在提高猪的瘦肉率时如何兼顾肌肉品质成为当今猪育种工作的重点。 

利用数量遗传学和传统育种手段对猪进行遗传改良已经取得长足进展，然而传统育种依赖种猪性能指标的测定，往往耗时数个月，增加了管理和饲养成本，同时测定的头数受到人力、物力和财力的限制，严重制约猪的遗传改良进展。因此，寻找一种操作简便，且能实施早期选择和评定的标准，对于猪的遗传育种工作非常重要。分子生物学的飞速发展使得猪的育种工作出现了新的曙光。利用遗传学或分子生物学手段对传统育种工作的不足之处进行了强有力的补充，也使得猪的育种能够突破传统育种工作面临的瓶颈问题，大大地促进了猪育种工作的发展。目前，标记辅助选择、影响猪重要数量性状的基因组区域定位、利用基因组扫描法和候选基因法研究影响猪重要经济性状的主效基因已经成功地应用到国内外的猪育种实践当中，取得了巨大的经济效益和社会效益。通过分子育种技术的实施，使猪的早期选择和定向精细育种逐渐成为现实。 

然而对于肉质及产肉量这类典型的数量性状，参与调控的基因数量庞大、种类繁多，基因间的互作关系对肉质及产肉量的共同作用及影响机制复杂，因此不能仅根据单个基因的变异指导猪的性状改良育种。尽管目前已有商业化的猪SNP芯片，可以通过全基因组关联分析实现全基因组分子标记的筛选及鉴定，然而芯片检测的成本相对较高，不利于实际育种中的大规模的检测应用。 

发明内容

本发明的目的是提供与猪肉质及产肉量相关的分子标记及其组合应用。 

本发明提供一组分子标记，由如下(1)-(3)所示的分子标记组成： 

(1)IGFBP6序列中含有IGFBP6-C44T多态性位点的分子标记，IGFBP6-C44T多态性位点是IGFBP6序列自5’末端起第830位，该位点具有C/T碱基的变异； 

所述IGFBP6序列的GenBank登录号为NM_001100190.1，更新日为2014年1月10日； 

(2)TRIM55序列中含有TRIM55-C213T多态性位点的分子标记，TRIM55-C213T多态性位点是TRIM55序列自5’末端起第1999位，该位点具有C/T碱基的变异； 

所述TRIM55序列的GenBank登录号为XM_005663049.1，更新日为2013年9月26日； 

(3)SDHD序列中含有SDHD-G131T多态性位点的分子标记，SDHD-G131T多态性位点是SDHD序列自5’末端起第444位，该位点具有G/T碱基的变异； 

所述SDHD序列的GenBank登录号为NM_001097516.1，更新日为2014年3月2日。 

上述分子标记中，所述IGFBP6序列中含有IGFBP6-C44T多态性位点的分子标记的序列如SEQ ID No.7所示； 

所述TRIM55序列中含有TRIM55-C213T多态性位点的分子标记的序列如SEQ IDNo.8所示； 

所述SDHD序列中含有SDHD-G131T多态性位点的分子标记的序列如SEQ ID No.9所示。 

一组引物也属于本发明的保护范围，由如下(1)-(3)所示的引物对组成： 

(1)SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的DNA分子； 

(2)SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的DNA分子； 

(3)SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的DNA分子； 

所述SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的DNA分子是扩增SEQ ID No.7所示的DNA分子的引物；